143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1657 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  100 
 
 
168 aa  324  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.78 
 
 
209 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  43.41 
 
 
196 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  43.35 
 
 
206 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 
213 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  36.59 
 
 
180 aa  121  5e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.66 
 
 
206 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.93 
 
 
196 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  39.38 
 
 
189 aa  120  8e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  42.53 
 
 
202 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  40.8 
 
 
201 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.62 
 
 
209 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  42.39 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  40.74 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  40.74 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  38.29 
 
 
224 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  39.52 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  40 
 
 
208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  41.41 
 
 
228 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  42.78 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.46 
 
 
230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.82 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.38 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  39.89 
 
 
258 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  40.67 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 
216 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  38.55 
 
 
206 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  40.74 
 
 
207 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.04 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.3 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  40.74 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  40 
 
 
189 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.33 
 
 
199 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.95 
 
 
216 aa  107  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.72 
 
 
194 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.84 
 
 
212 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.01 
 
 
189 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.01 
 
 
189 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.38 
 
 
212 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.04 
 
 
203 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.31 
 
 
201 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.35 
 
 
208 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.35 
 
 
208 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.46 
 
 
203 aa  104  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.97 
 
 
201 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.98 
 
 
216 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
184 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.72 
 
 
219 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.07 
 
 
224 aa  103  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.76 
 
 
234 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.94 
 
 
217 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.31 
 
 
214 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.41 
 
 
208 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.9 
 
 
220 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.29 
 
 
192 aa  100  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  41.21 
 
 
184 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.36 
 
 
211 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  34.03 
 
 
204 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.69 
 
 
192 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  42.26 
 
 
184 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  38.15 
 
 
181 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.55 
 
 
192 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  35.11 
 
 
205 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  40 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.54 
 
 
190 aa  97.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33.33 
 
 
187 aa  97.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  34.03 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.95 
 
 
207 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.71 
 
 
195 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.25 
 
 
206 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.15 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.62 
 
 
215 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.19 
 
 
224 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.95 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.95 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  33.33 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  35.76 
 
 
225 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.07 
 
 
201 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
205 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
205 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.14 
 
 
209 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.37 
 
 
226 aa  93.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33.92 
 
 
222 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
205 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  31.41 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  30.43 
 
 
198 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.23 
 
 
204 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  33.91 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.78 
 
 
189 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  36.09 
 
 
185 aa  91.3  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.06 
 
 
201 aa  90.5  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.92 
 
 
189 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.52 
 
 
226 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.63 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.36 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  35.4 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>