More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0150 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
388 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.81 
 
 
388 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0628663 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0215  ABC transporter, permease protein  51.97 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.49 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0224  ABC transporter, permease protein  52.49 
 
 
386 aa  306  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.11 
 
 
399 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.272859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2384  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.79 
 
 
392 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532854  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0498  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  46.07 
 
 
392 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
392 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
392 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28982  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733868  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.23 
 
 
392 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889052  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.26 
 
 
392 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2379  ABC transporter, permease protein  48.28 
 
 
406 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1975  amine ABC transporter, permease protein  48.15 
 
 
406 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1994  amine ABC transporter, permease protein  48.15 
 
 
406 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1139  ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 
386 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00529998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0238  amine ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 
406 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1579  amine ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 
406 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0921  amine ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 
406 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.73664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2133  ABC transporter, permease protein  48.15 
 
 
807 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
398 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225612  hitchhiker  0.00448624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
386 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.706116  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
400 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
384 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1330  quaternary amine ABC transporter permease  41.44 
 
 
384 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2785  quaternary amine ABC transporter permease  41.44 
 
 
384 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
385 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.782089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0914  quaternary amine ABC transporter permease  39.22 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.664933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2419  quaternary amine ABC transporter permease  39.83 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
385 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.89368  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3255  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, permease protein  39.83 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02060  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.94 
 
 
385 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2265  quaternary amine ABC transporter permease  38.94 
 
 
385 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02018  hypothetical protein  38.94 
 
 
385 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0843  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, permease protein  39.83 
 
 
385 aa  215  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
385 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2402  inner membrane ABC transporter permease YehY  37.5 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120526  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2353  inner membrane ABC transporter permease protein YehY  37.5 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2510  inner membrane ABC transporter permease YehY  37.22 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.579969  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2398  inner membrane ABC transporter permease YehY  37.22 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
386 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.255737  normal  0.184404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2309  inner membrane ABC transporter permease protein YehY  37.22 
 
 
389 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
383 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
389 aa  186  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3333  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.05 
 
 
524 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000937167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0267  quaternary amine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.28 
 
 
526 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1923  glycine betaine transport system permease protein  42.79 
 
 
526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1515  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.27 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0692577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0119  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  39.34 
 
 
523 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
218 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2993  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
217 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
222 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
217 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
217 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
525 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.615651  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7552  ABC glycinebetaine/carnitine/choline transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
217 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001529  probable inner-membrane permease  42.93 
 
 
199 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1070  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  42.42 
 
 
525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.019749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417886 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
220 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485727  normal  0.10095 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
217 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0902932  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
212 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
220 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.208767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease/glycine betaine/L-proline-binding protein  40.96 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0522  glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter, permease/substrate-binding protein  40.96 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.271995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2357  amino acid ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 
211 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
218 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
215 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3032  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  36.36 
 
 
531 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0914  choline ABC transporter permease and substrate binding protein  38.05 
 
 
500 aa  126  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0746  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.71 
 
 
504 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
211 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
522 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0875398  normal  0.252786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
216 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0763  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.71 
 
 
504 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.458546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1223  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  47.8 
 
 
512 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0386  ABC transporter, permease protein  42.03 
 
 
504 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1216  ABC transporter permease  45.56 
 
 
220 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0804  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.91 
 
 
217 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4576  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 
217 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4250  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.33 
 
 
217 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2494  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.33 
 
 
216 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0243  amino acid ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
211 aa  122  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
220 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
217 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471991  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
242 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.334865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.99 
 
 
434 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473063  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2130  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  38.5 
 
 
504 aa  119  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
211 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
211 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2030  amino acid ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
211 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.207242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
213 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518824  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13590  ABC transporter permease  42.86 
 
 
220 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>