More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0921 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1579  amine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
406 aa  744    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1975  amine ABC transporter, permease protein  99.75 
 
 
406 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1994  amine ABC transporter, permease protein  99.51 
 
 
406 aa  737    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1139  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
386 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00529998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2133  ABC transporter, permease protein  99.75 
 
 
807 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0921  amine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
406 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.73664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0238  amine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
406 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2379  ABC transporter, permease protein  90.89 
 
 
406 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0498  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  66.13 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.22 
 
 
392 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733868  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.49 
 
 
392 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.49 
 
 
392 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28982  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.57 
 
 
392 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.49 
 
 
392 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889052  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.76 
 
 
392 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.86 
 
 
399 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.272859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.57 
 
 
398 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0215  ABC transporter, permease protein  50.13 
 
 
386 aa  279  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0224  ABC transporter, permease protein  49.87 
 
 
386 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
400 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2384  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.95 
 
 
392 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.88 
 
 
388 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0628663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 
398 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225612  hitchhiker  0.00448624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.89368  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0914  quaternary amine ABC transporter permease  41.18 
 
 
385 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.664933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02060  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  46.1 
 
 
385 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2265  quaternary amine ABC transporter permease  46.1 
 
 
385 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02018  hypothetical protein  46.1 
 
 
385 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.88 
 
 
388 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3255  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, permease protein  40.91 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
385 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.782089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2419  quaternary amine ABC transporter permease  45.76 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0843  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, permease protein  40.64 
 
 
385 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2353  inner membrane ABC transporter permease protein YehY  42.08 
 
 
377 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2510  inner membrane ABC transporter permease YehY  42.08 
 
 
389 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.579969  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2398  inner membrane ABC transporter permease YehY  42.08 
 
 
389 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2309  inner membrane ABC transporter permease protein YehY  41.8 
 
 
389 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2402  inner membrane ABC transporter permease YehY  41.8 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120526  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
386 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.706116  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1330  quaternary amine ABC transporter permease  45.26 
 
 
384 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2785  quaternary amine ABC transporter permease  45.26 
 
 
384 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
384 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.98 
 
 
383 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 
389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.82 
 
 
392 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
386 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.255737  normal  0.184404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
217 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
217 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
220 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.208767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
217 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0902932  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7552  ABC glycinebetaine/carnitine/choline transporter, inner membrane subunit  40.65 
 
 
217 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2516  putative lipoprotein transmembrane  44.95 
 
 
520 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.2714  hitchhiker  0.00948908 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
220 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485727  normal  0.10095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
216 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2784  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.71 
 
 
504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0875398  normal  0.252786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2379  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  43.43 
 
 
518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2993  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  43.39 
 
 
217 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1598  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  42.52 
 
 
516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144217  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1923  glycine betaine transport system permease protein  41.27 
 
 
526 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
218 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0267  quaternary amine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  41.27 
 
 
526 aa  130  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2494  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.52 
 
 
216 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.89 
 
 
220 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3777  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  39.81 
 
 
520 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001529  probable inner-membrane permease  40 
 
 
199 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90895  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
224 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1451  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.36 
 
 
493 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
222 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
217 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471991  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3828  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  43.16 
 
 
520 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4576  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, permease protein  40 
 
 
217 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4250  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 
217 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.334865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0804  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.99 
 
 
217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
217 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476701  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
525 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.615651  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
217 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473063  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7550  ABC glycinebetaine/carnitine/choline transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 
238 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.93042  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1515  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  38.5 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0692577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
209 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
379 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 
212 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0914  choline ABC transporter permease and substrate binding protein  34.93 
 
 
500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0119  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  37.16 
 
 
523 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
245 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
247 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3333  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  37.5 
 
 
524 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000937167  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
238 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.191415  normal  0.0371863 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2130  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  38.42 
 
 
504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144284  normal  0.229592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
211 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1223  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  44.44 
 
 
512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0522  glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter, permease/substrate-binding protein  35.9 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.271995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1017  ABC-type proline/glycine betaine transport systems, permease and substrate binding protein  41.34 
 
 
508 aa  113  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00355742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>