More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5007 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5007  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 448 aa  906    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2061  histidinol dehydrogenase  55.84 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.164516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3581  histidinol dehydrogenase  54.32 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0208  histidinol dehydrogenase  51.51 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2155  histidinol dehydrogenase  52.17 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0829  histidinol dehydrogenase  51.72 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00615903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6310  histidinol dehydrogenase  51.83 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0958093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2689  histidinol dehydrogenase  41.36 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0200  histidinol dehydrogenase  41.74 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0462353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0205  histidinol dehydrogenase  41.74 
 
 		 434 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  38.17 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  38.83 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  39.53 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  39.19 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  40.68 
 
 		 431 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  38.71 
 
 		 427 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.51 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  39.06 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  39.81 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  36.82 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  37.97 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  38.01 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  36.08 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  36.38 
 
 		 426 aa  276  8e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  40.81 
 
 		 448 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  40.81 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  36.96 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  38.21 
 
 		 424 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.46 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  33.88 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  40.25 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  38.69 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  39 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  39.04 
 
 		 457 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  38.32 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  40.59 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  37.93 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  40.28 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  40.28 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  40.25 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  37.67 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  38 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  36.65 
 
 		 438 aa  270  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  35.49 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  37.05 
 
 		 429 aa  269  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_748  histidinol dehydrogenase  37.29 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.076765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  36.02 
 
 		 429 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 429 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  37.89 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  36.04 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  36.57 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  39.04 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  37.67 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  37.31 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  35.22 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 		 434 aa  267  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  36.05 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  36.05 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  36.02 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  36.02 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  37.22 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  38.89 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  38.89 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  35.8 
 
 		 437 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  39.04 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  38.05 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  37.22 
 
 		 434 aa  266  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 		 430 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  36.34 
 
 		 434 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  35.75 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  38.66 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  37.76 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  36.27 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  39.5 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  37.77 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  39.04 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  37.95 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  35.82 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  38.66 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  38.66 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  39.8 
 
 		 440 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>