More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0208 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0208  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 448 aa  901    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2061  histidinol dehydrogenase  55.32 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.164516  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2155  histidinol dehydrogenase  57.01 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0829  histidinol dehydrogenase  56.32 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00615903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6310  histidinol dehydrogenase  55.99 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0958093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3581  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5007  histidinol dehydrogenase  51.51 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2689  histidinol dehydrogenase  43.56 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0200  histidinol dehydrogenase  43.62 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0462353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0205  histidinol dehydrogenase  43.62 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  39.24 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  38.76 
 
 		 437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.95 
 
 		 426 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 		 426 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  39.81 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  39.76 
 
 		 422 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  38.97 
 
 		 425 aa  272  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  38.28 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  38.54 
 
 		 427 aa  266  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  34.66 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  36.56 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  35.45 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  36.8 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  33.87 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  37.14 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  36.21 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  36.94 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  36.3 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  39.71 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  34.8 
 
 		 425 aa  256  8e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  34.89 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  35.32 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  35.45 
 
 		 430 aa  253  6e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  37.89 
 
 		 435 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  35.96 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  34.74 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  34.74 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  36.68 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  38.12 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  35 
 
 		 433 aa  250  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  34.94 
 
 		 428 aa  249  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  35.5 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  37.37 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  33.57 
 
 		 430 aa  247  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  38.12 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  37.37 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  34.95 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  35.21 
 
 		 424 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  36.05 
 
 		 434 aa  246  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 427 aa  246  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  36.63 
 
 		 448 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  36.05 
 
 		 430 aa  246  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  36.9 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  38.69 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  34.46 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  39.47 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  38.83 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  36.04 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  36.62 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  38.56 
 
 		 431 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  33.33 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  36.78 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  33.89 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  37.94 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  35.28 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  37.82 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  36.57 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  36.8 
 
 		 448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 		 439 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  38.58 
 
 		 434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  36.91 
 
 		 434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 		 439 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  37.59 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  38.58 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0693  histidinol dehydrogenase  37.37 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.950085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  34.87 
 
 		 416 aa  240  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  37.17 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  35.42 
 
 		 429 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  34.72 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  35.42 
 
 		 429 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>