More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2061 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2061  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 446 aa  917    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.164516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3581  histidinol dehydrogenase  58.66 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5007  histidinol dehydrogenase  55.84 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2155  histidinol dehydrogenase  56.85 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0829  histidinol dehydrogenase  56.62 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00615903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6310  histidinol dehydrogenase  57.8 
 
 		 442 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0958093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0208  histidinol dehydrogenase  55.32 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2689  histidinol dehydrogenase  46.84 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0205  histidinol dehydrogenase  45.29 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0200  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0462353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  41.5 
 
 		 424 aa  326  6e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  39.72 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  40.44 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  39.21 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  39.86 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  41.65 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  35.76 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 430 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  39.13 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  38.13 
 
 		 427 aa  289  9e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  36.14 
 
 		 436 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  38.41 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 		 424 aa  286  7e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  38.65 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  38.25 
 
 		 434 aa  283  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  36.68 
 
 		 424 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  38.55 
 
 		 428 aa  282  9e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  37.05 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  37.85 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  38.19 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  36.26 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  37.35 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  36.87 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  36.72 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  36.62 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  39.03 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  37.84 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  37.62 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  37.73 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  36.81 
 
 		 422 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  38.79 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  37.99 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  35.34 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  36.84 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  38.44 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  35.41 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  37.68 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  35.97 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.8 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2013  histidinol dehydrogenase  36.04 
 
 		 444 aa  267  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  38.04 
 
 		 432 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  36.69 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  34.64 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  37.29 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  36.87 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  37.37 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.63 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  36.23 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  36.78 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  36.78 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  36.87 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  36.87 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0844  histidinol dehydrogenase  36.28 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  38.69 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  37.03 
 
 		 429 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  37.03 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  38.35 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  37.03 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  37.32 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  36.84 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  36.32 
 
 		 852 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  35.84 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  36.64 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  35.27 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  38.54 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  36.59 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1332  histidinol dehydrogenase  39.23 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  36.51 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2478  histidinol dehydrogenase  37.35 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  35.95 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  35.94 
 
 		 433 aa  259  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  36.66 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0763  histidinol dehydrogenase  36.52 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  34.44 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>