More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2155 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6310  histidinol dehydrogenase  77.55 
 
 		 442 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0958093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3581  histidinol dehydrogenase  76.31 
 
 		 438 aa  646    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0829  histidinol dehydrogenase  98.41 
 
 		 441 aa  871    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00615903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2155  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  882    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2061  histidinol dehydrogenase  56.85 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.164516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0208  histidinol dehydrogenase  57.01 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5007  histidinol dehydrogenase  52.17 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0205  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0200  histidinol dehydrogenase  48.49 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0462353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2689  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  39.91 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  38.52 
 
 		 433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  35.88 
 
 		 424 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  41.65 
 
 		 425 aa  272  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  38.61 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  35.68 
 
 		 426 aa  266  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  34.96 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  37.92 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  36.32 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  35.44 
 
 		 426 aa  262  6.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  36.96 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2478  histidinol dehydrogenase  39.17 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  36.66 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  38.12 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 		 426 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  37.8 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.77 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  38.22 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  35.68 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 		 454 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1869  histidinol dehydrogenase  39.07 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0023  histidinol dehydrogenase  38.88 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  37.11 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1709  histidinol dehydrogenase  36.3 
 
 		 428 aa  256  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 429 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  255  9e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  35.93 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  39.4 
 
 		 424 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 		 430 aa  253  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  37.03 
 
 		 441 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  34.43 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1767  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  33.96 
 
 		 424 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  35.99 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  37.31 
 
 		 436 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 		 431 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  33.25 
 
 		 430 aa  249  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  38.01 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  37.16 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  37.31 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  39.3 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  36.86 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  34.22 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  37.28 
 
 		 433 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  33.73 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  34.76 
 
 		 429 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  34.61 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  34.76 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  34.62 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  34.61 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  37.97 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  33.73 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  34.84 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  39.01 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  34.86 
 
 		 427 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  35.61 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  38.77 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  36.74 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  34.84 
 
 		 429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  34.61 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 431 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  34.61 
 
 		 429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  33.74 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  34.37 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  38.77 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  36.8 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  33.1 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  37.41 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  35.63 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1478  histidinol dehydrogenase  35.98 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  36.96 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  35.58 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  40.5 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  36.18 
 
 		 457 aa  237  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  40.5 
 
 		 431 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  39.31 
 
 		 431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 		 430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  36.18 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>