216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0322 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  98.93 
 
 
373 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
373 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  84.93 
 
 
371 aa  594  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  73.73 
 
 
371 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  66.96 
 
 
369 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  58.66 
 
 
357 aa  428  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  58.66 
 
 
413 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  56.79 
 
 
370 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  56.42 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  57.8 
 
 
370 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  56.13 
 
 
377 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  56.41 
 
 
375 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  56.13 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  55.84 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  56.4 
 
 
367 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  53.97 
 
 
367 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  51.06 
 
 
380 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  50.8 
 
 
380 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  53.39 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  52.3 
 
 
378 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.6 
 
 
371 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  52.53 
 
 
378 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  50.72 
 
 
401 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  48.37 
 
 
374 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 
371 aa  329  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  51.16 
 
 
373 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  51.87 
 
 
376 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 
378 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
374 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  52.27 
 
 
368 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
373 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 
383 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 
373 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  49.16 
 
 
370 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  51.01 
 
 
365 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  48.93 
 
 
363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  48.93 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  47.72 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  45.72 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 
374 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  48.14 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  48.64 
 
 
364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.6 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  47.19 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 
367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  46.77 
 
 
384 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  45.14 
 
 
376 aa  299  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  49.05 
 
 
365 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  48.43 
 
 
398 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  47.04 
 
 
392 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  47.62 
 
 
386 aa  292  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
370 aa  292  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.7 
 
 
398 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
367 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  46.46 
 
 
367 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 
386 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  47.89 
 
 
369 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.28 
 
 
369 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.28 
 
 
369 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  44.77 
 
 
370 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 
369 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  49.04 
 
 
378 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 
369 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  45.77 
 
 
371 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  44.41 
 
 
372 aa  285  7e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  43.97 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  45.72 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  43.67 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  46.46 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  47.71 
 
 
374 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 
367 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 
367 aa  279  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  44.83 
 
 
367 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  42.93 
 
 
369 aa  279  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  46.8 
 
 
377 aa  278  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  44.85 
 
 
370 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  44.3 
 
 
363 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
364 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  43.75 
 
 
363 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  44.96 
 
 
391 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  44.96 
 
 
391 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 
384 aa  276  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  43.4 
 
 
368 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  44.09 
 
 
369 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  44.35 
 
 
365 aa  273  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  44.85 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  44.76 
 
 
376 aa  273  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  42.78 
 
 
377 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  42.67 
 
 
366 aa  272  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 
363 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  45.85 
 
 
369 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  44.44 
 
 
372 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  44.44 
 
 
372 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  43.56 
 
 
363 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  44.07 
 
 
379 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 
366 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.89 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>