216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3041 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 380 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  91.88 
 
 		 378 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  95.81 
 
 		 376 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  99.74 
 
 		 380 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  85.39 
 
 		 377 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  84.97 
 
 		 371 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  72.99 
 
 		 374 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  70.6 
 
 		 374 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  71.63 
 
 		 373 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  71.92 
 
 		 373 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  69.7 
 
 		 378 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  71.3 
 
 		 373 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  72.29 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  63.39 
 
 		 378 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  60.76 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  58.54 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  55.97 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  53.66 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  52.69 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  54.2 
 
 		 365 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  52.75 
 
 		 367 aa  361  9e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  52.34 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  53.12 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 		 370 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  54.73 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  53.7 
 
 		 367 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  51.25 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  52.49 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  51.21 
 
 		 373 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  52.62 
 
 		 364 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  50.8 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  54.15 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  53.09 
 
 		 368 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  53.74 
 
 		 412 aa  348  8e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  52.62 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  52.21 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  52.62 
 
 		 363 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  51.75 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  51.81 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  52.73 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  51.56 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  53.96 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  50.68 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  51.72 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  51.3 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  51.88 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 370 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  51.72 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  50.72 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  47.03 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 365 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  51.5 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.57 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  47.76 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  46.85 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  50.69 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  45.68 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.2 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.2 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  48.41 
 
 		 362 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  45.65 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  45.58 
 
 		 369 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  45.86 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  46.03 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  47.69 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  46.38 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  46.38 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  44.64 
 
 		 391 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  45.17 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.53 
 
 		 369 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  45.36 
 
 		 391 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  45.36 
 
 		 391 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  45.03 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  46.65 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  47.16 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  44.83 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  47.06 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  45.45 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  45.09 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  45.45 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  45.94 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  47.38 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  44.26 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  45.94 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  45.01 
 
 		 392 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  44.89 
 
 		 376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  44.14 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>