216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5520 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  93.33 
 
 
373 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  92.29 
 
 
373 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  88.1 
 
 
378 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  93.14 
 
 
373 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
374 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  89.91 
 
 
374 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  91.09 
 
 
374 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  77.27 
 
 
377 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  77.39 
 
 
371 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  76.23 
 
 
378 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  70.88 
 
 
380 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  70.6 
 
 
380 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  72.97 
 
 
376 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  63.69 
 
 
378 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  59.52 
 
 
383 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  56.95 
 
 
371 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  55.65 
 
 
371 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  54.96 
 
 
384 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  53.74 
 
 
370 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  54.65 
 
 
365 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  54.65 
 
 
368 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  51.74 
 
 
370 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  52.09 
 
 
366 aa  358  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 
398 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 
386 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 
398 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  53.41 
 
 
366 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  52.09 
 
 
367 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 
364 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  52.33 
 
 
368 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  51.64 
 
 
386 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  53.62 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 
377 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 
375 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  47.83 
 
 
371 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  53.33 
 
 
363 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  49.01 
 
 
370 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  52.48 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
412 aa  338  9e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  48.9 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  50.28 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  51.97 
 
 
365 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  47.92 
 
 
369 aa  334  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  52.65 
 
 
367 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
371 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  48.37 
 
 
373 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.37 
 
 
373 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
357 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 
367 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 
367 aa  326  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
371 aa  322  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  52.19 
 
 
374 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  48.85 
 
 
369 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  50.15 
 
 
372 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.55 
 
 
367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 
370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  46.48 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  47.8 
 
 
380 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 
363 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  47.08 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.46 
 
 
362 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  48.98 
 
 
371 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  46.8 
 
 
363 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.28 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.28 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  43.35 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  48.75 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  48.87 
 
 
361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  45.82 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  45.82 
 
 
369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  45.5 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  44.75 
 
 
363 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.65 
 
 
377 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  45.53 
 
 
401 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  46.34 
 
 
392 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.24 
 
 
371 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  44.89 
 
 
365 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  46.93 
 
 
373 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.85 
 
 
390 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  44.82 
 
 
363 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  44.82 
 
 
363 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 
394 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 
392 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  45.29 
 
 
391 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  45.29 
 
 
391 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 
392 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  45.29 
 
 
391 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
401 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
400 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
397 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  45.65 
 
 
370 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
400 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
394 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 
366 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>