216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1344 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  93.85 
 
 		 374 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  85.71 
 
 		 378 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  92.82 
 
 		 373 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 374 aa  731    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  87.43 
 
 		 374 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  91.67 
 
 		 373 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  90.72 
 
 		 373 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  76.64 
 
 		 377 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  76.52 
 
 		 371 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  75.94 
 
 		 378 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  69.52 
 
 		 380 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  69.79 
 
 		 380 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  72.38 
 
 		 376 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  66.57 
 
 		 378 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  60.9 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  57.26 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  58.4 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  56.1 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  56.1 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  55.23 
 
 		 368 aa  362  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  53.59 
 
 		 364 aa  358  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  53.16 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  54.36 
 
 		 366 aa  355  8.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  52.03 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  52.27 
 
 		 386 aa  352  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  51.21 
 
 		 386 aa  352  7e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  52.71 
 
 		 366 aa  352  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  51.74 
 
 		 398 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  51.29 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  51.64 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  51.49 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  52.72 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  51.55 
 
 		 367 aa  345  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 377 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  54.05 
 
 		 363 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  50.28 
 
 		 375 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 412 aa  338  7e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 		 367 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 		 363 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  47.61 
 
 		 369 aa  333  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  52.09 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  48.64 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.37 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  51.39 
 
 		 378 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 413 aa  328  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  53.67 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 371 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  52.48 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 		 370 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  50.73 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  47.91 
 
 		 372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  48.23 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  48.58 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  48.01 
 
 		 369 aa  308  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  48.62 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  49.56 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  46.88 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  46.76 
 
 		 369 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  47.15 
 
 		 369 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  47.53 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  47.73 
 
 		 369 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.98 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  47.22 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.26 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  46.72 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  44.05 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  47.81 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  46.67 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  48.33 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  48 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  48.33 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 		 361 aa  298  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 		 394 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 		 400 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  45.85 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  47.95 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  46.03 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  43.58 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 		 366 aa  297  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>