216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0597 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  100 
 
 		 369 aa  749    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  62.25 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  58.5 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  56.51 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  56.43 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  54.1 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  54.81 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  52.47 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  50.94 
 
 		 386 aa  355  7.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  51.3 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 		 383 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  47.92 
 
 		 374 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  47.03 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  47.03 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  47.44 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  47.32 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  48.12 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  48.97 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  47.21 
 
 		 373 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  46.92 
 
 		 373 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 373 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  51.74 
 
 		 370 aa  325  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  49.58 
 
 		 375 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.83 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  47.09 
 
 		 391 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  47.81 
 
 		 372 aa  322  9.000000000000001e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  46.77 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  45.07 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  51.31 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  46.67 
 
 		 367 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 369 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 369 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  46.74 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  46.58 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  47.68 
 
 		 392 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 376 aa  315  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  46.32 
 
 		 376 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  45.71 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  45.95 
 
 		 380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  48.41 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  47.09 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 		 394 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  47.88 
 
 		 397 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  47.88 
 
 		 401 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  45.78 
 
 		 367 aa  312  6.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  47.19 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  45.8 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  48.02 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  47.03 
 
 		 401 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  45.01 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  47.95 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  45.19 
 
 		 369 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  45.19 
 
 		 369 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  46.7 
 
 		 386 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  48.54 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 		 363 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  44.35 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.58 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  46.11 
 
 		 372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  46.44 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  46.11 
 
 		 372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  44.9 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  45.97 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  44.56 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  46.67 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  45.19 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  44.63 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  46.67 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  45.3 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.58 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  45.58 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  45.58 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  45.58 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  45.3 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  45.18 
 
 		 367 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 361 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  46.42 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  44.88 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>