216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2849 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 383 aa  750    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  64.31 
 
 		 378 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  61.04 
 
 		 380 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  60.76 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  63.01 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  63.01 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  63.14 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  61.6 
 
 		 374 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  59.52 
 
 		 374 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  60.27 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  58.05 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  60.68 
 
 		 373 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  60.98 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  61.27 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  60.11 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  56.23 
 
 		 371 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  55.98 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  55.91 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  53.85 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  52.62 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  52.07 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  54.06 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  53.53 
 
 		 384 aa  355  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  52.6 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  52.02 
 
 		 398 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  52.84 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  52.19 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  49.18 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  52.04 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  51.28 
 
 		 367 aa  342  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  52.08 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  53.99 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  51.74 
 
 		 370 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  53.15 
 
 		 363 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  51.85 
 
 		 375 aa  338  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  53.15 
 
 		 363 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  51.85 
 
 		 377 aa  338  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  52.56 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  51.23 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  51.57 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  51.86 
 
 		 366 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  48.9 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  51.85 
 
 		 413 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  51 
 
 		 357 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  47.65 
 
 		 370 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  51.9 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.13 
 
 		 371 aa  319  5e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 369 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.24 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  51.01 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  49.15 
 
 		 372 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  48.91 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  48.26 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  48.85 
 
 		 370 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  46.29 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  45.55 
 
 		 376 aa  293  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  48.16 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  45.72 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  44.76 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  44.76 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  44.91 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  44.53 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  45.31 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  45.26 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  44.8 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  44.38 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  47.54 
 
 		 371 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  46.36 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  45.13 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  45.13 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  44.69 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  45.2 
 
 		 351 aa  275  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  42.19 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  44.35 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  42.36 
 
 		 369 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  42.36 
 
 		 369 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  46.34 
 
 		 365 aa  272  9e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  44.05 
 
 		 386 aa  272  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  44.57 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  43.05 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  47.78 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  41.92 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>