216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06161 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
372 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
372 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  86.76 
 
 
376 aa  611  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  68.13 
 
 
380 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  65.99 
 
 
367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  63.43 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  65.42 
 
 
369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  65.42 
 
 
369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  63.43 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  62.57 
 
 
386 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  63.26 
 
 
371 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  64.16 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  62.98 
 
 
369 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  62.86 
 
 
369 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  60.93 
 
 
369 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  61.71 
 
 
362 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  59.34 
 
 
365 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  61.14 
 
 
379 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  60.74 
 
 
376 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  57.1 
 
 
370 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  57.85 
 
 
363 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  60.23 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  55.68 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  57.49 
 
 
366 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  53.76 
 
 
366 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  56.57 
 
 
363 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  56.57 
 
 
363 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  56.57 
 
 
363 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  56.57 
 
 
363 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  55.43 
 
 
363 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  55.71 
 
 
363 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  55.71 
 
 
363 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  54.1 
 
 
364 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  53.66 
 
 
368 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  54.95 
 
 
363 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 
363 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  53.13 
 
 
363 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  54.14 
 
 
363 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  53.57 
 
 
363 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  52.08 
 
 
391 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  55.31 
 
 
377 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  55.3 
 
 
361 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  52.88 
 
 
363 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  52.32 
 
 
363 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  53.17 
 
 
373 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  53.15 
 
 
377 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  51.56 
 
 
391 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  51.56 
 
 
391 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  51.34 
 
 
364 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  53.58 
 
 
369 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  52.04 
 
 
390 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
401 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
401 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
400 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
400 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
394 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
397 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  51.2 
 
 
392 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
401 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  52.38 
 
 
397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  52.37 
 
 
392 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  52.09 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  53.07 
 
 
392 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  57.26 
 
 
374 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  54.44 
 
 
394 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  53.37 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  53.37 
 
 
372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  51.36 
 
 
367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  54.87 
 
 
365 aa  355  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 
369 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  54.6 
 
 
362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  50.39 
 
 
391 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  53.6 
 
 
368 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  51.51 
 
 
371 aa  349  6e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  53.28 
 
 
392 aa  348  9e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  50.82 
 
 
398 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  51.81 
 
 
371 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  48.91 
 
 
378 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 
382 aa  343  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  51.79 
 
 
367 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  48.69 
 
 
395 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  51.14 
 
 
385 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  50.97 
 
 
372 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  51.52 
 
 
367 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  50.98 
 
 
395 aa  339  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  50.84 
 
 
371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
371 aa  336  5e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  49.71 
 
 
370 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  50.56 
 
 
371 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
369 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2591  flagellar basal body P-ring protein  50.71 
 
 
369 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  49.58 
 
 
370 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  51.29 
 
 
371 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  51.3 
 
 
366 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  50.98 
 
 
376 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  52.01 
 
 
374 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  48.73 
 
 
372 aa  322  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  52.87 
 
 
371 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 
381 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 
375 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>