216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0213 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 364 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  57.49 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  59.39 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  58.71 
 
 		 372 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  57.77 
 
 		 391 aa  434  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  56.75 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  57.02 
 
 		 366 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  57.38 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  57.38 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  60.81 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  54.82 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  58.21 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  57.35 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  55.56 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  53.76 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  57.64 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  53.35 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  56.77 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  53.35 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  53.07 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  53.07 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  53.91 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  53.63 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  51.78 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  53.91 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  53.91 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  52.86 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  55.56 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  53.89 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  51.25 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  52.92 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  51.34 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  51.34 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 		 366 aa  362  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  52.07 
 
 		 363 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  53.49 
 
 		 372 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 376 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  50.68 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 		 366 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 363 aa  352  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  51.74 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  50.28 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  49.44 
 
 		 362 aa  346  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  50.72 
 
 		 363 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 363 aa  345  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  50.56 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  49.01 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 368 aa  341  9e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  48.71 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 370 aa  332  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  47.54 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  50.97 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  48.33 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 		 370 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 369 aa  325  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 		 385 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 		 369 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 		 397 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  48 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  48 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 		 394 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  48.73 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  46.74 
 
 		 384 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  47.88 
 
 		 381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  50.58 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  48.59 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  48.22 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  48.26 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  47.71 
 
 		 385 aa  311  9e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  48.3 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  48.3 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  48.45 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  48.59 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  44.85 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  47.28 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  47.74 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 		 371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  44.72 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  47.44 
 
 		 368 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>