216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2331 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
373 aa  750    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  84.44 
 
 
363 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  83.62 
 
 
361 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004166  flagellar P-ring protein FlgI  85.61 
 
 
278 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  65.74 
 
 
363 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  65.74 
 
 
363 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  65.46 
 
 
363 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  65.18 
 
 
363 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  65.73 
 
 
363 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  65.74 
 
 
363 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  65.74 
 
 
363 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  64.62 
 
 
363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  64.44 
 
 
368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  63.89 
 
 
363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  64.54 
 
 
363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  65.17 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  65.51 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  63.19 
 
 
364 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  64.41 
 
 
363 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  62.64 
 
 
366 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  62.53 
 
 
363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  61.25 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  61.14 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  59.78 
 
 
365 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  60.38 
 
 
379 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  60.22 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  60.22 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  59.67 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  60.22 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  60.86 
 
 
362 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  56.38 
 
 
380 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  56.87 
 
 
362 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  57.97 
 
 
386 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  57.18 
 
 
366 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  58.2 
 
 
369 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  57.92 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  58.96 
 
 
369 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  58.96 
 
 
369 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  54.5 
 
 
376 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  53.23 
 
 
372 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  53.74 
 
 
367 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  55.65 
 
 
401 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  53.17 
 
 
372 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  53.17 
 
 
372 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 
376 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
367 aa  355  8.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  51.06 
 
 
374 aa  352  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 
371 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  48.22 
 
 
367 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  51.41 
 
 
371 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  50.86 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  50.28 
 
 
369 aa  339  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  50.85 
 
 
371 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  49.56 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  46.88 
 
 
370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  47.95 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  47.87 
 
 
371 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  48.73 
 
 
372 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  47.54 
 
 
364 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 
390 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  49.03 
 
 
365 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
384 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 
391 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 
391 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 
391 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  48 
 
 
369 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  47.63 
 
 
394 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 
392 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 
392 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 
371 aa  318  7e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
376 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
397 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  48.43 
 
 
370 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
401 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  47.23 
 
 
377 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  44.57 
 
 
368 aa  316  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 
400 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 
400 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  48.01 
 
 
372 aa  315  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 
397 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 
394 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2418  flagellar basal body P-ring protein  47.84 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.097185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2005  flagellar basal body P-ring protein  47.84 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  48.3 
 
 
375 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  48.7 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  48.73 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2317  flagellar basal body P-ring protein  47.84 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  47.19 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 
388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  47.28 
 
 
381 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  47.43 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  47.28 
 
 
394 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  47.86 
 
 
372 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  47.86 
 
 
372 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  45.77 
 
 
392 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  47.28 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  48.15 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>