216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02921 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
370 aa  733    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  80 
 
 
370 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  67.03 
 
 
363 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  67.48 
 
 
363 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  67.48 
 
 
363 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  67.48 
 
 
363 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  67.48 
 
 
363 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  65.32 
 
 
366 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  65.95 
 
 
364 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  66.58 
 
 
363 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  66.85 
 
 
363 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  66.49 
 
 
363 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  68.57 
 
 
363 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  65.76 
 
 
363 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  66.3 
 
 
363 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  66.04 
 
 
363 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  66.12 
 
 
368 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  64.59 
 
 
363 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  66.22 
 
 
363 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  62.02 
 
 
363 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  63.28 
 
 
361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  61.14 
 
 
373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  58.93 
 
 
369 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  58.93 
 
 
369 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  58.62 
 
 
371 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  59.22 
 
 
380 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  59.3 
 
 
386 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  58.4 
 
 
369 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  58.29 
 
 
369 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  60.38 
 
 
369 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  60.06 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  60.06 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  57.1 
 
 
372 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  59.66 
 
 
401 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  60.66 
 
 
379 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  60.4 
 
 
365 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  57.1 
 
 
372 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  59.27 
 
 
362 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  55.38 
 
 
376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  56.99 
 
 
367 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  57.49 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  55.59 
 
 
366 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  55.84 
 
 
362 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  52.63 
 
 
372 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  50.94 
 
 
378 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  50.27 
 
 
370 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004166  flagellar P-ring protein FlgI  60.78 
 
 
278 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  49.6 
 
 
367 aa  348  8e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  51.33 
 
 
371 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  49.33 
 
 
367 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  50.56 
 
 
375 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  51.24 
 
 
371 aa  344  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
370 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  51.8 
 
 
371 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  49.04 
 
 
372 aa  341  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  51.25 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  46.61 
 
 
367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 
364 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  52.12 
 
 
371 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  51.84 
 
 
376 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  47.44 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  47.03 
 
 
391 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  47.17 
 
 
392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
371 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  48.62 
 
 
372 aa  318  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 
366 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  43.97 
 
 
368 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  47.61 
 
 
374 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  49.2 
 
 
374 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  45.55 
 
 
371 aa  309  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  47.27 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  49.58 
 
 
388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  46.48 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  47.04 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  47.2 
 
 
382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.88 
 
 
371 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  47.2 
 
 
387 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 
365 aa  298  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  48 
 
 
357 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  45.88 
 
 
401 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
394 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  46.76 
 
 
392 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  44.84 
 
 
372 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  44.84 
 
 
372 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
401 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
397 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  48 
 
 
413 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
400 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
400 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
394 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
397 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  45.68 
 
 
384 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  46.46 
 
 
368 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
401 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
367 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.33 
 
 
390 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  43.86 
 
 
391 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  43.86 
 
 
391 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  44.81 
 
 
394 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>