216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1153 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
367 aa  736    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  60.77 
 
 
369 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  62.32 
 
 
368 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  61.45 
 
 
368 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  60 
 
 
365 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  57.31 
 
 
398 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  55.31 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  56.73 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  57.18 
 
 
363 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  53.6 
 
 
371 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  48.9 
 
 
370 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  50.83 
 
 
386 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 
383 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  49.18 
 
 
378 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  51.23 
 
 
378 aa  332  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 
380 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  47.18 
 
 
378 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  48.49 
 
 
380 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
378 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  48.55 
 
 
373 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  48.34 
 
 
372 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  48.26 
 
 
373 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  48.6 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  49.01 
 
 
374 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
370 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  48.99 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  47.97 
 
 
373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  49.86 
 
 
401 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  51.87 
 
 
370 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 
374 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 
377 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  49.04 
 
 
380 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.41 
 
 
369 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  47.68 
 
 
367 aa  322  9.000000000000001e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  48.36 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
374 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  49.16 
 
 
375 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 
377 aa  315  6e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  46.05 
 
 
376 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  48.94 
 
 
371 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 
376 aa  314  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  48.97 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  47.53 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  46.92 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
413 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  46.45 
 
 
373 aa  311  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.3 
 
 
369 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  47.84 
 
 
370 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  48.63 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  48.58 
 
 
361 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  44.9 
 
 
365 aa  308  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.54 
 
 
390 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  48.48 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  44.09 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  44.75 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  44.75 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  47.31 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  48.4 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  46.76 
 
 
363 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  49.27 
 
 
365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 
367 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  46.46 
 
 
412 aa  305  8.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  45.48 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  43.51 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  46.47 
 
 
386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  45.05 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  45.05 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  44.57 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  46.47 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  45.73 
 
 
363 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  46.34 
 
 
379 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  45.86 
 
 
377 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 
372 aa  301  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  46.61 
 
 
385 aa  301  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 
372 aa  301  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  46.02 
 
 
365 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  44.1 
 
 
397 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 
392 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  44.1 
 
 
401 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 
397 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 
401 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 
400 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 
394 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  45.41 
 
 
367 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  45.55 
 
 
371 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 
400 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  44.93 
 
 
369 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  43.54 
 
 
401 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  44.93 
 
 
369 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>