215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0062 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
375 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  83.24 
 
 
376 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  80.17 
 
 
372 aa  591  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  78.43 
 
 
370 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  78.81 
 
 
371 aa  558  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  58.58 
 
 
378 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  57.68 
 
 
370 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  56.27 
 
 
368 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  56.37 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  59.37 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  56.47 
 
 
364 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  56.16 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  56.45 
 
 
366 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  51.82 
 
 
386 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  53.26 
 
 
387 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  51.75 
 
 
371 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  53.26 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  51.48 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  51.48 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  49.33 
 
 
363 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  51.48 
 
 
369 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  51.75 
 
 
369 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  51.3 
 
 
365 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  53.67 
 
 
401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  51.49 
 
 
379 aa  351  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  49.06 
 
 
380 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  49.07 
 
 
363 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  49.07 
 
 
363 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  50.94 
 
 
369 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  49.6 
 
 
370 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  48.53 
 
 
368 aa  347  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  48.53 
 
 
363 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  47.84 
 
 
364 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  51.86 
 
 
369 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  51.86 
 
 
369 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  49.73 
 
 
372 aa  345  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  49.05 
 
 
363 aa  345  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  50.7 
 
 
374 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  47.98 
 
 
366 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  48.53 
 
 
363 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  48.51 
 
 
363 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  50.56 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
363 aa  342  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
376 aa  342  5e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  48.24 
 
 
363 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.51 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  47.99 
 
 
362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  48.11 
 
 
366 aa  338  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  49.05 
 
 
363 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  48.28 
 
 
370 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  49.32 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  46.67 
 
 
363 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 
372 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  49.3 
 
 
372 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  46.87 
 
 
361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  46.79 
 
 
371 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  47.28 
 
 
373 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  49.15 
 
 
371 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 
371 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 
367 aa  311  9e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  45.3 
 
 
367 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  47.3 
 
 
371 aa  305  8.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 
369 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  46.01 
 
 
365 aa  296  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  47.16 
 
 
377 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  47.06 
 
 
385 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  46.93 
 
 
377 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  45.14 
 
 
392 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 
369 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  46.3 
 
 
374 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  44.68 
 
 
381 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  48.16 
 
 
374 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3835  flagellar basal body P-ring protein  47.88 
 
 
374 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  45.2 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  44.76 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  44.01 
 
 
397 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 
401 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  39.95 
 
 
367 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  46.44 
 
 
388 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  44.01 
 
 
401 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  44.01 
 
 
400 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  44.01 
 
 
400 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  44.01 
 
 
394 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  41.95 
 
 
392 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 
397 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  42.55 
 
 
390 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 
401 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  46.44 
 
 
382 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  42.62 
 
 
391 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  42.62 
 
 
391 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  42.62 
 
 
391 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 
392 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 
394 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  45.11 
 
 
367 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  44.15 
 
 
384 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  43.78 
 
 
369 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>