215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3461 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  95.97 
 
 		 370 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 372 aa  748    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  83.76 
 
 		 371 aa  588  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  80.17 
 
 		 375 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  81.69 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  59.67 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  59.67 
 
 		 370 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  58.86 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  57.53 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  54.01 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  55.38 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  50.94 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  53.11 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  49.87 
 
 		 363 aa  359  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  53.11 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  53.11 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  56.29 
 
 		 371 aa  358  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  56 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  53.11 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  49.06 
 
 		 376 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  50.81 
 
 		 380 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  49.05 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  53.3 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  49.05 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  53.3 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  50.85 
 
 		 363 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  49.04 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  50.85 
 
 		 363 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  50.72 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  48.77 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 363 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  47.44 
 
 		 363 aa  349  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  49.33 
 
 		 374 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  52.11 
 
 		 401 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  48.39 
 
 		 364 aa  348  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  51.39 
 
 		 369 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  52.12 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  49.87 
 
 		 363 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  47.93 
 
 		 368 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  51.13 
 
 		 362 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  48.4 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  48.72 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  49.33 
 
 		 372 aa  342  7e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  50.68 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  50.95 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  49.03 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  49.07 
 
 		 370 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  48.64 
 
 		 376 aa  332  7.000000000000001e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  48.92 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  48.92 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  48.39 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  46.61 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  50.28 
 
 		 371 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 371 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 		 371 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  45.82 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  41.4 
 
 		 367 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.74 
 
 		 377 aa  291  9e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  45.11 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  46.18 
 
 		 377 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.03 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  46.84 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  44.65 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  43.8 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  43.8 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  43.53 
 
 		 391 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  44.29 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  43.53 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  43.53 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  44.01 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  44.01 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  44.48 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  43.01 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  42.63 
 
 		 374 aa  279  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  43.22 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  44.17 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  45.4 
 
 		 367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  45.11 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  42.03 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  42.49 
 
 		 369 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  44.02 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  44.76 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>