216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0270 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  98.09 
 
 		 366 aa  718    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 371 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  69.81 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  70.06 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  56.75 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  59.13 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  57.57 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  56.45 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  59.6 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  56.16 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  56.86 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  56.29 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  54.85 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  56.36 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  56.36 
 
 		 387 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  57.47 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  52.47 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  52.6 
 
 		 401 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  51.81 
 
 		 376 aa  342  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  49.05 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  49.46 
 
 		 380 aa  335  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  51.29 
 
 		 372 aa  335  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  51.29 
 
 		 372 aa  335  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  51.87 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  51.87 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  48.48 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 370 aa  329  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  48.63 
 
 		 366 aa  328  9e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  50.87 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  50 
 
 		 369 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  48.23 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  48.23 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  47.68 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  48.5 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 363 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  50.99 
 
 		 370 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  49.57 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  49.14 
 
 		 361 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  47.68 
 
 		 363 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  48.61 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  49.31 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  49.57 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  48.28 
 
 		 373 aa  308  9e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  48.25 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2591  flagellar basal body P-ring protein  50.57 
 
 		 369 aa  306  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  46.97 
 
 		 377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  48.99 
 
 		 367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  48.7 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 		 385 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 381 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  47.79 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  47.56 
 
 		 379 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 401 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  48.18 
 
 		 394 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  48.62 
 
 		 394 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  48.62 
 
 		 392 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  48.19 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 		 392 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  47.63 
 
 		 392 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  46.49 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  45.45 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  48 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01076  flagellar P-ring protein precursor I  47.27 
 
 		 365 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2566  flagellar P-ring protein  47.27 
 
 		 365 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01084  hypothetical protein  47.27 
 
 		 365 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.981614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1203  flagellar basal body P-ring protein  47.27 
 
 		 365 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1459  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31008  hitchhiker  0.000149159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2048  flagellar basal body P-ring protein  48.56 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.159552  normal  0.112526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  46.01 
 
 		 385 aa  292  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  46.74 
 
 		 374 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  46.78 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>