216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3097 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
386 aa  770    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  57.42 
 
 
364 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  50.94 
 
 
369 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  55.91 
 
 
368 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 
374 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  53.61 
 
 
363 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  52.73 
 
 
380 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  52.73 
 
 
380 aa  359  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  51.24 
 
 
378 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  52.03 
 
 
374 aa  358  6e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  51.88 
 
 
373 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  51.88 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.18 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
368 aa  355  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  53.18 
 
 
378 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  51.3 
 
 
373 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  53.8 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  53.62 
 
 
365 aa  352  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  53.8 
 
 
398 aa  352  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  52.33 
 
 
367 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  51.82 
 
 
377 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  51.79 
 
 
378 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  52.56 
 
 
383 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  52.71 
 
 
374 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  53.33 
 
 
376 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  51.65 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  46.88 
 
 
371 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.41 
 
 
371 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  48.09 
 
 
365 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 
367 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  47.01 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  48.85 
 
 
361 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  47.77 
 
 
363 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.03 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  48.91 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  47.15 
 
 
377 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  48.3 
 
 
373 aa  309  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  46.79 
 
 
392 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  44.95 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  47.04 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 
370 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  46.93 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.66 
 
 
401 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  48.19 
 
 
392 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  48.19 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 
357 aa  305  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 
397 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 
367 aa  306  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
413 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
401 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 
401 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  46.97 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  50.86 
 
 
370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  49.14 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  46.04 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  48.2 
 
 
372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  46.77 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
363 aa  301  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  45.64 
 
 
384 aa  301  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
373 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  47.62 
 
 
373 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 
372 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 
363 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 
368 aa  299  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  45.5 
 
 
380 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 
376 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  46.65 
 
 
365 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  48.14 
 
 
363 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  48.99 
 
 
371 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 
381 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 
371 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 
362 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 
412 aa  295  6e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 
369 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  45 
 
 
363 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  47.61 
 
 
369 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  47.32 
 
 
369 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 
392 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  50 
 
 
365 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  47.97 
 
 
369 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  47.97 
 
 
369 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
369 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
369 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  45.63 
 
 
366 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.66 
 
 
377 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  44.72 
 
 
363 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  45.73 
 
 
398 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  44.2 
 
 
372 aa  292  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  44.2 
 
 
372 aa  292  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  44.51 
 
 
378 aa  291  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>