216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3843 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 398 aa  794    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  96.23 
 
 		 398 aa  749    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  76.4 
 
 		 368 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  74 
 
 		 368 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  74.34 
 
 		 365 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  68.07 
 
 		 363 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  66.67 
 
 		 364 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  56.73 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  52.72 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 		 374 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  52.03 
 
 		 374 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  51.16 
 
 		 378 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  51.8 
 
 		 383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  52.42 
 
 		 377 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  50.58 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  50.87 
 
 		 373 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 373 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  50.97 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  51.88 
 
 		 378 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  53.26 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  52.03 
 
 		 374 aa  343  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  50.72 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  50.69 
 
 		 380 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.83 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  48.15 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 		 370 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 		 376 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 		 378 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.74 
 
 		 369 aa  312  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  47.03 
 
 		 380 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.98 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  46.7 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  46.84 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 		 376 aa  308  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  48.7 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  45.65 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  43.67 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  48.7 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  47.25 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  49.58 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  47.54 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.31 
 
 		 362 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 		 375 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  47.97 
 
 		 369 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  46.98 
 
 		 392 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  43.36 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  47.84 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  47.43 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 397 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 363 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  46.99 
 
 		 363 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 386 aa  301  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  45.76 
 
 		 366 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  46.57 
 
 		 370 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  44.68 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  46.38 
 
 		 368 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  45.28 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  44.59 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  44.88 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  47.31 
 
 		 373 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  45.84 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  45.71 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  45.45 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  46.55 
 
 		 412 aa  292  7e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  46.49 
 
 		 372 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  43.41 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1560  flagellar basal body P-ring protein  45.86 
 
 		 369 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.750011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 		 365 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  45.65 
 
 		 370 aa  290  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  46.49 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>