216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2425 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 378 aa  753    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  84.2 
 
 		 374 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  74.32 
 
 		 370 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  71.43 
 
 		 370 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  68.77 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  52.59 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 		 374 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  51.5 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  52.19 
 
 		 374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  51.4 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  48.9 
 
 		 378 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  53.33 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  49.59 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  53.49 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  52.29 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  50.44 
 
 		 373 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  52.92 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  50.44 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  51.52 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  50.97 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  50.73 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  50.69 
 
 		 380 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  52.33 
 
 		 378 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  52.34 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  51.41 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  51.38 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  51.38 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  51.59 
 
 		 372 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  50.87 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  49.43 
 
 		 366 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  50.99 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  50.85 
 
 		 377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  49.86 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.7 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  47.58 
 
 		 371 aa  319  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 		 373 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  49.04 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  50.7 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.93 
 
 		 369 aa  316  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  48.47 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  48.79 
 
 		 380 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  50.42 
 
 		 365 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  48.29 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  48.38 
 
 		 363 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.88 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 		 370 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 371 aa  311  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  48.64 
 
 		 363 aa  311  9e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  48.69 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  48.5 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  48.35 
 
 		 363 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  48.59 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  48.26 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  47.12 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  47.12 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  47.04 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 		 413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  46.8 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  48.34 
 
 		 368 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  47.81 
 
 		 376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  48.34 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  48.35 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  47.56 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  47.56 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  46.76 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  48.72 
 
 		 372 aa  301  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 		 390 aa  301  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  48.72 
 
 		 372 aa  301  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  46.85 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  46.52 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  47.51 
 
 		 394 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  47.51 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 401 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 		 378 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>