216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2942 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 367 aa  724    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  72.95 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  71.35 
 
 		 363 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  72.21 
 
 		 367 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  71.07 
 
 		 363 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  71.43 
 
 		 365 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  65.11 
 
 		 366 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  55.72 
 
 		 378 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  53.02 
 
 		 380 aa  362  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  52.75 
 
 		 380 aa  361  9e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  52.43 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  54.52 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  54.52 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  52.04 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  53.96 
 
 		 376 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  52.48 
 
 		 373 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  53.06 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  52.87 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  52.48 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  52.77 
 
 		 378 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  51.9 
 
 		 373 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  52.97 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  48.76 
 
 		 386 aa  329  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 368 aa  329  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 		 384 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  49.32 
 
 		 364 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  46.67 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 357 aa  319  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  51.31 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  48.41 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  48.7 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  49.15 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  47.17 
 
 		 370 aa  311  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  47.58 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  48.34 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  48.58 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 		 398 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.17 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 367 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  46.42 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  47.06 
 
 		 372 aa  298  8e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.21 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  48.07 
 
 		 367 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  45.14 
 
 		 371 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  42.54 
 
 		 370 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  44.88 
 
 		 376 aa  288  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  46.47 
 
 		 378 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  46.57 
 
 		 385 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  43.94 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  43.94 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  44.5 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  46.67 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  43.55 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  43.24 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  45.07 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  45.07 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  43.72 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  46.97 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  43.22 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  42.94 
 
 		 401 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  43.22 
 
 		 397 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  43.98 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  45.17 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  44.38 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  46.8 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  43.47 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  43.94 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  43.2 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  44.31 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  42.2 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  42.2 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  42.02 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  42.62 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  42.62 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  44.47 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  44.96 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  42.3 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  43.25 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  45.4 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  44.48 
 
 		 376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  44.09 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  45.51 
 
 		 365 aa  265  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  43.13 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>