216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2004 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 370 aa  740    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  74.32 
 
 		 378 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  73.04 
 
 		 374 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  69.94 
 
 		 370 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  64.27 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  51.02 
 
 		 374 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  49.01 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  46.52 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  48.98 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 		 377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  48.98 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  48.98 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  48.48 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  49.86 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  48.1 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 365 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  48.55 
 
 		 378 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  50.85 
 
 		 374 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  49.86 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  48.54 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  47.65 
 
 		 383 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 		 398 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  48.15 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  48.26 
 
 		 376 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  49.16 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 375 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  49.16 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  47.65 
 
 		 363 aa  315  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 		 377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.14 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  48.08 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  46.47 
 
 		 367 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  48.08 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  48.62 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  48.23 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 369 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.98 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  48.71 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  48.75 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  47.33 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  47.63 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.58 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.23 
 
 		 377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  46.43 
 
 		 369 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  44.63 
 
 		 371 aa  301  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  47.91 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  44.9 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  45.82 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  46 
 
 		 363 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  46 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  46.09 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  47.21 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  46.09 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  46.7 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  44.83 
 
 		 378 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 391 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  44.51 
 
 		 366 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  44.99 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  47.53 
 
 		 363 aa  295  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  46.67 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  45.99 
 
 		 391 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  45.99 
 
 		 391 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  45.33 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  45.83 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  45.4 
 
 		 357 aa  293  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  44.81 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  47.08 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  46.8 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  45.11 
 
 		 413 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  45.56 
 
 		 376 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  44.99 
 
 		 412 aa  290  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  42.54 
 
 		 367 aa  289  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  45.96 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  43.63 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  44.99 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>