216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3376 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 367 aa  715    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  72.95 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  71.12 
 
 		 367 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  68.96 
 
 		 363 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  68.68 
 
 		 363 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  68.96 
 
 		 365 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  62.91 
 
 		 366 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  54.84 
 
 		 378 aa  349  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  50.27 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  53.96 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  53.96 
 
 		 380 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  52.08 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  51.9 
 
 		 371 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  52.19 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  53.67 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  49.01 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  50.15 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  50.44 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  49.59 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  50.15 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  48.82 
 
 		 371 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  51.31 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  49.85 
 
 		 373 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 		 370 aa  318  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  48.02 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  50.58 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  48.85 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 386 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  48.85 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.78 
 
 		 369 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  47.96 
 
 		 363 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  48.16 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  46.03 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  48.49 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  49.56 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  48.71 
 
 		 412 aa  305  7e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  48.71 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  45.53 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  45.81 
 
 		 366 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  45.78 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  45.65 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  44.02 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  43.2 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  42.65 
 
 		 371 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  43.63 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  44.25 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 		 369 aa  275  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  45.24 
 
 		 369 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  45.24 
 
 		 369 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  43.09 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  43.09 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  44.14 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  43.44 
 
 		 377 aa  271  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  42.82 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  43.68 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  41.81 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  42.09 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  42.09 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  42.09 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  42.09 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  42.09 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 		 370 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  42.19 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  44.04 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  41.81 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  41.81 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  41.94 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  43.71 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  40.37 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  40.37 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  40.37 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  41.1 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  42.7 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  41.41 
 
 		 394 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  41.41 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  41.91 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  40.97 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  43.17 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  43.06 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  41.19 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  42.94 
 
 		 401 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  41.83 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  42.65 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  44.06 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  43.56 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  40.72 
 
 		 395 aa  255  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  41.42 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  40.97 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  43.36 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  43.49 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>