216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2699 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 366 aa  720    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  69.78 
 
 		 363 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  69.78 
 
 		 363 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  68.03 
 
 		 365 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  66.58 
 
 		 367 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  65.11 
 
 		 367 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  62.91 
 
 		 367 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  54.06 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  52.09 
 
 		 374 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  53.96 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  51.53 
 
 		 380 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  51.25 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  54.05 
 
 		 374 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  51.64 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  53.69 
 
 		 377 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.94 
 
 		 371 aa  352  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  53.35 
 
 		 373 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  50.99 
 
 		 378 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  52.16 
 
 		 373 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  52.62 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  54.07 
 
 		 374 aa  342  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  53.37 
 
 		 376 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  50.54 
 
 		 369 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  51.4 
 
 		 412 aa  332  5e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  51.27 
 
 		 413 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  50.99 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  48.39 
 
 		 371 aa  328  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 370 aa  328  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 371 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 		 368 aa  324  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  48.32 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  48.75 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  48.71 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  48.47 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 367 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  47.43 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  47.15 
 
 		 367 aa  318  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  46.58 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  50.44 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  47.04 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  46.58 
 
 		 363 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  48.08 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  47.72 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  47.45 
 
 		 373 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  48.99 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 		 398 aa  308  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  49.43 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  44.51 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  45.64 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  46.19 
 
 		 372 aa  292  5e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  43.8 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  44.2 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  45.27 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  43.55 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  45.27 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  43.21 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  43.21 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  43.14 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  43.22 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  43.22 
 
 		 401 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  42.57 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  42.57 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  43.6 
 
 		 392 aa  272  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  45.71 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  42.94 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  42.94 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  45.08 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  42.94 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  42.94 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  42.94 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  42.47 
 
 		 377 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  42.66 
 
 		 401 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  42.47 
 
 		 394 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  46.36 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  42.47 
 
 		 392 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 		 391 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  42.29 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  44.85 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  43.72 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  41.3 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  42.49 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  42.33 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  41.78 
 
 		 378 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  42.05 
 
 		 369 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  44.64 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  46.29 
 
 		 374 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  46.29 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  44.23 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  43.36 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  43.43 
 
 		 401 aa  262  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  42.57 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>