216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1099 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 367 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  64.93 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  65.8 
 
 		 377 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  62.4 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  65.23 
 
 		 375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  64.39 
 
 		 366 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  64.94 
 
 		 375 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  62.12 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  62.07 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  62.07 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  58.38 
 
 		 369 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  59.48 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  53.95 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  53.97 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  53.17 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  54.49 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  51.88 
 
 		 380 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  51.88 
 
 		 380 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  53.76 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 378 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  52.65 
 
 		 374 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  52.99 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  52.87 
 
 		 374 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  52.42 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  54.18 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  50.82 
 
 		 378 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  52.75 
 
 		 373 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  52.23 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  54.05 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  53.82 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  51.29 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  47.45 
 
 		 371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  49.32 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  51.9 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 363 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  47.58 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  48.36 
 
 		 368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  47.95 
 
 		 364 aa  318  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  48.07 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  50.13 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  48.14 
 
 		 367 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  47.85 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 		 371 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  48.57 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.61 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  47.24 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.41 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.71 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 		 398 aa  295  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.34 
 
 		 369 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.34 
 
 		 369 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.26 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  43.96 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  46.22 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 		 371 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  45.41 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  46.42 
 
 		 368 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.84 
 
 		 369 aa  285  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  46.05 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  47.25 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  45.31 
 
 		 369 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  44.17 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  45.04 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  44.99 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  44.57 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  44.2 
 
 		 363 aa  278  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  44.47 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  44.47 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  44.47 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.53 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  43.55 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 378 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  45.26 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.18 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  44.2 
 
 		 367 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  44.54 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  43.31 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  45.3 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  43.67 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  44.84 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  42.86 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  42.86 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  42.86 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  45.48 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  45.01 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>