216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3155 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
370 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  77.59 
 
 
374 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  72.25 
 
 
371 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  72.22 
 
 
378 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  67.76 
 
 
370 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  50.84 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  51.87 
 
 
367 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  52.29 
 
 
368 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  50.88 
 
 
398 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  51.46 
 
 
398 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  51.59 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  51.4 
 
 
368 aa  342  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  48.68 
 
 
378 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  49.15 
 
 
364 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  47.33 
 
 
380 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  48.26 
 
 
383 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 
371 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  47.06 
 
 
380 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 
378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  48.69 
 
 
374 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  45.97 
 
 
374 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.39 
 
 
373 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
377 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
375 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  47.81 
 
 
373 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  49.6 
 
 
386 aa  322  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
375 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  48.12 
 
 
373 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 
373 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  47.88 
 
 
376 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 
373 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 
378 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  51.16 
 
 
370 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
357 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 
369 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  48.39 
 
 
372 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 
391 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 
391 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
371 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  49.86 
 
 
401 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  47.17 
 
 
377 aa  316  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  48.14 
 
 
377 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 
371 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  48.72 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  47.4 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 
376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  48.13 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  49.73 
 
 
369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  46.01 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 
369 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  48.44 
 
 
362 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 
372 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 
372 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  46.58 
 
 
367 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  47.8 
 
 
367 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  47.24 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  47.83 
 
 
392 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  48.36 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  47.25 
 
 
363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  47.86 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  49.03 
 
 
392 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 
401 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  46.47 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  48.31 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  48.75 
 
 
394 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  48.03 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  47.4 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  48.01 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 
363 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  45.14 
 
 
371 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  48.07 
 
 
363 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  47.79 
 
 
363 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 
363 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  47.51 
 
 
364 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  45.28 
 
 
366 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 
363 aa  299  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  48.2 
 
 
370 aa  298  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  45.93 
 
 
395 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  46.3 
 
 
363 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  47.62 
 
 
368 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 
398 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  45.8 
 
 
370 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  46.51 
 
 
376 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  46.18 
 
 
412 aa  294  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>