216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2556 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  100 
 
 		 378 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  68.79 
 
 		 371 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  67.71 
 
 		 377 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  66.76 
 
 		 374 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  63.39 
 
 		 380 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  63.66 
 
 		 380 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  63.69 
 
 		 374 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  65.9 
 
 		 378 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  65.14 
 
 		 373 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  61.58 
 
 		 378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  65.14 
 
 		 373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  65.42 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  66.57 
 
 		 374 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  64.31 
 
 		 383 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  61.93 
 
 		 371 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  64.64 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  60.48 
 
 		 371 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  58.79 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  52.43 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  53.62 
 
 		 368 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  54.62 
 
 		 386 aa  358  8e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  53.33 
 
 		 365 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  53.3 
 
 		 370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  51.64 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  53.07 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  52.15 
 
 		 370 aa  348  6e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  52.47 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  50.94 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  52.7 
 
 		 363 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  52.43 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  52.26 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  52.42 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  52.54 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  52.26 
 
 		 375 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  52.53 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  52.27 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  51.01 
 
 		 364 aa  332  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  51.79 
 
 		 386 aa  332  9e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  49.16 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  50.82 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  53.49 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  49.87 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 371 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  51.5 
 
 		 378 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.07 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  49.06 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  50.71 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  52.12 
 
 		 374 aa  318  9e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  45.1 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  48.56 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  48.41 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  44.3 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  44.09 
 
 		 380 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  45.14 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  46.42 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  42.13 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  44.33 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  44.03 
 
 		 366 aa  279  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 401 aa  278  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  44.97 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  50 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  43.15 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  43.15 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  44.97 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  44.97 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  43.15 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  44.97 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  44.97 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  44.69 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  44.69 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  45.01 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  45.01 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.18 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  43.66 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  45.28 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  43.7 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  44.14 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  43.87 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  43.98 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  44.63 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  43.85 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  43.72 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  44.23 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  44 
 
 		 377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  43.08 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>