216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3651 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
370 aa  731    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  69.13 
 
 
367 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  66.09 
 
 
370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  63.53 
 
 
375 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  63.82 
 
 
377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  63.25 
 
 
375 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  61.54 
 
 
366 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  62.4 
 
 
367 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  56.79 
 
 
373 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  56.25 
 
 
373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  57.41 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  55.91 
 
 
357 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  56.2 
 
 
413 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  55.62 
 
 
369 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 
412 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  56.1 
 
 
371 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  53.93 
 
 
380 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  53.66 
 
 
380 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  55.37 
 
 
377 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  55.65 
 
 
378 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  51.74 
 
 
374 aa  358  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  55.33 
 
 
371 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  53.39 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  52.15 
 
 
378 aa  348  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 
378 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  51.71 
 
 
374 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  51.85 
 
 
373 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  51.85 
 
 
373 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 
371 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  51.74 
 
 
383 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  51.16 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  52.54 
 
 
374 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  47.48 
 
 
371 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
366 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  49.46 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  49.87 
 
 
386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 
363 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 
363 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  46.92 
 
 
365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  47.17 
 
 
367 aa  311  9e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.8 
 
 
369 aa  309  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  46.03 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  48.19 
 
 
365 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  48.42 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  46.61 
 
 
368 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  47.31 
 
 
367 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  45.55 
 
 
367 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
364 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 
363 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  45.95 
 
 
380 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.86 
 
 
377 aa  292  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.26 
 
 
401 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  45.68 
 
 
371 aa  291  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  45.28 
 
 
390 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 
398 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  44.59 
 
 
377 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  45.21 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  46.4 
 
 
394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  45.21 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  45.21 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  45.26 
 
 
392 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  44.44 
 
 
392 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 
368 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  44.89 
 
 
369 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  46.53 
 
 
398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
401 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 
365 aa  285  8e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  45.05 
 
 
392 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
394 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
401 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  43.78 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  45.05 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  46.55 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  44.05 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  47.4 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  45.53 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 
372 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 
372 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  43.63 
 
 
369 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  43.63 
 
 
369 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  44.02 
 
 
371 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 
386 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  44.2 
 
 
363 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 
378 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  43.05 
 
 
363 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.8 
 
 
370 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  44.99 
 
 
362 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2591  flagellar basal body P-ring protein  46.78 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1875  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
369 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  43.32 
 
 
372 aa  272  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  43.05 
 
 
386 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  42.28 
 
 
363 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>