216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0742 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 371 aa  728    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  80.86 
 
 		 373 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  84.27 
 
 		 373 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  75.74 
 
 		 371 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  62.8 
 
 		 369 aa  461  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  57.67 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  57.97 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  55.4 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  54.83 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  56.52 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  55.11 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  55.27 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  52.83 
 
 		 367 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  54.5 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  52.59 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  53.16 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  52.01 
 
 		 380 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  52.92 
 
 		 377 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  51.72 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.03 
 
 		 371 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  51.07 
 
 		 378 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  49.43 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  52.16 
 
 		 376 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  48.23 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  49.85 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 373 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  49.31 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  47.99 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  47.99 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  48.86 
 
 		 373 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  48.1 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  47.07 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 		 371 aa  311  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  48.1 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  48.11 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  46.34 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  47.75 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  48.27 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  48.7 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.4 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.84 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 		 370 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  48.72 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  45.7 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  44.09 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  47.95 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  47.96 
 
 		 386 aa  292  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 378 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  46.89 
 
 		 367 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  44 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  45.87 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  43.78 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  45.12 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  46.57 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  45.11 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  45.04 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  43.77 
 
 		 365 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  45.48 
 
 		 363 aa  276  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  44.73 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  46 
 
 		 369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  44.47 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.62 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  46 
 
 		 369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  44.68 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  44.68 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  44.68 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  42.08 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  44.14 
 
 		 369 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  44.14 
 
 		 369 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  46 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  43.06 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  45.01 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  44.93 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  43.4 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  44 
 
 		 363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  44.19 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  42.74 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  42.74 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  44.35 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  43.65 
 
 		 364 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  43.51 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 400 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 394 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  42.93 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  45.01 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 400 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  42.18 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  42.18 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  43.16 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>