216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1307 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 363 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  99.72 
 
 		 363 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  85.75 
 
 		 365 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  69.78 
 
 		 366 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  71.35 
 
 		 367 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  72.48 
 
 		 367 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  68.68 
 
 		 367 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  52.89 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  52.62 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  52.43 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  53.47 
 
 		 378 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  53.62 
 
 		 374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.31 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  53.22 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  54.18 
 
 		 413 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  53.76 
 
 		 374 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  53.15 
 
 		 383 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  53.35 
 
 		 373 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  52.46 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  52.59 
 
 		 373 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  50.83 
 
 		 378 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  52.31 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  53.37 
 
 		 376 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  54.34 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  50.4 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  50.56 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 		 369 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 		 375 aa  322  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  51.69 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  49.58 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  51.12 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  49.45 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  51.28 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  48.93 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.66 
 
 		 373 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  51.3 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  49.58 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  50.41 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  48.87 
 
 		 366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  51.38 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  46.67 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  46 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.32 
 
 		 369 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 		 367 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  47.3 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  47.57 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  47.61 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.7 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  47.12 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  45.63 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  45.74 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  45.78 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  44.96 
 
 		 369 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  44.96 
 
 		 369 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  48.27 
 
 		 401 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  45.87 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  48.14 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  44.69 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 		 374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  45.23 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  47.5 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.74 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  44.14 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  45.89 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  46.94 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  47.46 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  45.7 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  44.81 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  45.63 
 
 		 376 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 400 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 400 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 397 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 397 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 401 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  44.51 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  45.87 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  44.69 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  44.54 
 
 		 394 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  44.92 
 
 		 385 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  46.11 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  44.54 
 
 		 392 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  43.16 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  43.25 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  44.78 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  42.78 
 
 		 363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  42.51 
 
 		 364 aa  268  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>