More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0456 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  88.93 
 
 		 614 aa  1119    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  100 
 
 		 614 aa  1253    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  64.84 
 
 		 621 aa  795    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  61.64 
 
 		 636 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  88.93 
 
 		 614 aa  1118    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  53 
 
 		 578 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  50.27 
 
 		 589 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  50.09 
 
 		 589 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  50.09 
 
 		 589 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  49.55 
 
 		 589 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  49.73 
 
 		 589 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  49.91 
 
 		 589 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  49.55 
 
 		 575 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  47.48 
 
 		 577 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 588 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 588 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 588 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.2 
 
 		 584 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.2 
 
 		 588 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  47.5 
 
 		 583 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.2 
 
 		 588 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  49.55 
 
 		 589 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.02 
 
 		 588 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  46.62 
 
 		 613 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  48.48 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  48.42 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  46.22 
 
 		 610 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  45.05 
 
 		 614 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  44.6 
 
 		 588 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  48.04 
 
 		 606 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  44.56 
 
 		 593 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  45.18 
 
 		 579 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  44.73 
 
 		 586 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  48.48 
 
 		 572 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  44.09 
 
 		 587 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.09 
 
 		 587 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  44.76 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  40.39 
 
 		 590 aa  465  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  42.86 
 
 		 599 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  45.41 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  44.62 
 
 		 630 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  42.66 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  43.46 
 
 		 596 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  43.27 
 
 		 596 aa  429  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  43.19 
 
 		 708 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  43.28 
 
 		 704 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  43.09 
 
 		 712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  42.23 
 
 		 704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  42.41 
 
 		 713 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  40.64 
 
 		 595 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.34 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  38.11 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  39.11 
 
 		 602 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  39.18 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  38.83 
 
 		 605 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  38.77 
 
 		 615 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  38.42 
 
 		 626 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  38.05 
 
 		 701 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  37.54 
 
 		 712 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  37.75 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  38.56 
 
 		 603 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  36.98 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  39.32 
 
 		 606 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  36.8 
 
 		 651 aa  359  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  37.63 
 
 		 600 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  36.28 
 
 		 660 aa  357  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  36.64 
 
 		 642 aa  355  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  37.21 
 
 		 591 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  37.3 
 
 		 597 aa  351  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  35.29 
 
 		 674 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  35.23 
 
 		 666 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  35.55 
 
 		 609 aa  335  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  33.84 
 
 		 636 aa  330  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  33.67 
 
 		 634 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  33.67 
 
 		 636 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.72 
 
 		 549 aa  320  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.47 
 
 		 590 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  32.55 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  36.88 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  36.49 
 
 		 626 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  34.62 
 
 		 534 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  36.85 
 
 		 588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  31.79 
 
 		 616 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.77 
 
 		 639 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  35.62 
 
 		 602 aa  310  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  36.71 
 
 		 560 aa  310  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  33.92 
 
 		 665 aa  310  6.999999999999999e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  33.21 
 
 		 589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  32.26 
 
 		 635 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  36.35 
 
 		 667 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  35.16 
 
 		 637 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  32.36 
 
 		 633 aa  303  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  36.72 
 
 		 576 aa  303  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  32.82 
 
 		 662 aa  301  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  32.64 
 
 		 662 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 		 660 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  32.75 
 
 		 629 aa  299  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  33.74 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  33.15 
 
 		 660 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>