More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4198 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  72.99 
 
 		 666 aa  892    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  77 
 
 		 660 aa  918    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  72.31 
 
 		 674 aa  886    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  100 
 
 		 591 aa  1199    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  96.09 
 
 		 642 aa  1104    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  79.03 
 
 		 651 aa  959    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  38.99 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  37.84 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  36.82 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  36.77 
 
 		 630 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  36.82 
 
 		 579 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  36.84 
 
 		 578 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  35.83 
 
 		 583 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  36.33 
 
 		 636 aa  355  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  36.35 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  36.07 
 
 		 575 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  36.6 
 
 		 614 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  36.6 
 
 		 614 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  34.31 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  35.05 
 
 		 614 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  35.45 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  34.54 
 
 		 589 aa  343  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  36.36 
 
 		 596 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.41 
 
 		 592 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  35.27 
 
 		 613 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  35.19 
 
 		 621 aa  339  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.82 
 
 		 589 aa  339  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  34.86 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  34.56 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  34.38 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  34.86 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  34.38 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  37.64 
 
 		 614 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  35.57 
 
 		 593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  37.2 
 
 		 596 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  34.86 
 
 		 583 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  33.09 
 
 		 590 aa  334  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  34.88 
 
 		 713 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  35.16 
 
 		 602 aa  329  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  35.22 
 
 		 708 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  32.97 
 
 		 563 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  34.85 
 
 		 588 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  34.15 
 
 		 712 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  33.03 
 
 		 704 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.09 
 
 		 588 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  33.03 
 
 		 712 aa  324  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  35.6 
 
 		 588 aa  323  5e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.09 
 
 		 584 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 		 588 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 		 588 aa  323  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  33.64 
 
 		 587 aa  323  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.09 
 
 		 588 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 		 588 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.64 
 
 		 587 aa  323  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.09 
 
 		 588 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 588 aa  319  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  32.68 
 
 		 704 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  34.9 
 
 		 701 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  35.14 
 
 		 572 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  32.97 
 
 		 629 aa  306  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  33.52 
 
 		 609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  33.69 
 
 		 595 aa  300  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  33.21 
 
 		 602 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  33.02 
 
 		 605 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  33.4 
 
 		 615 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  32.9 
 
 		 626 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  34.51 
 
 		 603 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  31.24 
 
 		 621 aa  289  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6480  putative ABC transporter-like protein  43.6 
 
 		 374 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  31.24 
 
 		 621 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.45 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  32.78 
 
 		 597 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.78 
 
 		 598 aa  280  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  30.98 
 
 		 557 aa  277  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  31.48 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  31.45 
 
 		 606 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  30.51 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  30.26 
 
 		 616 aa  270  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  30.33 
 
 		 621 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  31.65 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  30.58 
 
 		 636 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  30.58 
 
 		 634 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  30.58 
 
 		 636 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  32.65 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3628  ABC transporter-like  41.4 
 
 		 368 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.519453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  30.31 
 
 		 606 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 		 549 aa  259  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  31.79 
 
 		 600 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  30.04 
 
 		 660 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  30.81 
 
 		 635 aa  252  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.44 
 
 		 590 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  30.6 
 
 		 637 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1935  SbmABacA family protein  40 
 
 		 370 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585773  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  32.1 
 
 		 658 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  31.42 
 
 		 596 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  28.31 
 
 		 662 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5526  ABC transporter domain protein  31.59 
 
 		 587 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 660 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  29.72 
 
 		 667 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>