More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0163 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  89.55 
 
 		 674 aa  1203    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 666 aa  1355    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  76.2 
 
 		 651 aa  963    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  72.99 
 
 		 591 aa  892    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  73.84 
 
 		 642 aa  937    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  73.65 
 
 		 660 aa  925    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  36.01 
 
 		 575 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  36.33 
 
 		 588 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  37.11 
 
 		 606 aa  364  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  35.46 
 
 		 621 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  35.92 
 
 		 579 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  34.97 
 
 		 578 aa  355  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  34.01 
 
 		 589 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.36 
 
 		 592 aa  349  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.39 
 
 		 589 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  34.38 
 
 		 636 aa  347  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  35.69 
 
 		 614 aa  347  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  35.91 
 
 		 586 aa  347  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  35.51 
 
 		 614 aa  346  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  35.66 
 
 		 614 aa  346  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  34.19 
 
 		 583 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  34.86 
 
 		 577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.28 
 
 		 587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  34.28 
 
 		 587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  33.56 
 
 		 589 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  35.48 
 
 		 630 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  33.39 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  35.88 
 
 		 596 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  34.36 
 
 		 610 aa  340  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  33.22 
 
 		 589 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  33.22 
 
 		 589 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  33.04 
 
 		 589 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  35.15 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 		 588 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 		 588 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 		 584 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  32.08 
 
 		 595 aa  331  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  34.52 
 
 		 614 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  34.75 
 
 		 588 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  36.62 
 
 		 596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  35.4 
 
 		 708 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  35.54 
 
 		 713 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  33.09 
 
 		 712 aa  328  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  32.29 
 
 		 590 aa  327  3e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 577 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  33.94 
 
 		 593 aa  326  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  34.39 
 
 		 583 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  32.88 
 
 		 602 aa  325  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  35.12 
 
 		 572 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  33.46 
 
 		 704 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  35.7 
 
 		 701 aa  319  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  34.02 
 
 		 712 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  35.61 
 
 		 588 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  33.21 
 
 		 704 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.39 
 
 		 599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  33.82 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  33.76 
 
 		 609 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  33.21 
 
 		 563 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  31.96 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  32.9 
 
 		 605 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6480  putative ABC transporter-like protein  40.11 
 
 		 374 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  30.65 
 
 		 629 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  32.23 
 
 		 626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  31.89 
 
 		 615 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  33.9 
 
 		 597 aa  281  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  32.28 
 
 		 602 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  29.04 
 
 		 621 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  29.78 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  32.57 
 
 		 603 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  30.88 
 
 		 557 aa  277  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  28.87 
 
 		 621 aa  276  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  32.28 
 
 		 606 aa  276  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  30.93 
 
 		 606 aa  270  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  29.82 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  29.7 
 
 		 623 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  29.53 
 
 		 616 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  29.42 
 
 		 636 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  29.42 
 
 		 634 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  29.42 
 
 		 636 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.62 
 
 		 598 aa  262  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  31.54 
 
 		 635 aa  256  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  30.8 
 
 		 668 aa  256  9e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3628  ABC transporter-like  40.7 
 
 		 368 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.519453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1935  SbmABacA family protein  40.41 
 
 		 370 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585773  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.11 
 
 		 549 aa  254  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  31.26 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  31.23 
 
 		 600 aa  254  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  32.45 
 
 		 596 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  29.12 
 
 		 660 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  31.2 
 
 		 637 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1839  ABC transporter-like  38.63 
 
 		 370 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  30.44 
 
 		 667 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 		 660 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  27.67 
 
 		 611 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  28.8 
 
 		 660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>