More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00771 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  100 
 
 
660 aa  1339    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  56.53 
 
 
662 aa  770    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  56.69 
 
 
662 aa  771    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  51.23 
 
 
668 aa  666    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  57.83 
 
 
658 aa  778    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  56.1 
 
 
662 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  95.45 
 
 
660 aa  1286    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  90.3 
 
 
660 aa  1233    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  69.67 
 
 
667 aa  969    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  97.27 
 
 
660 aa  1308    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  44.63 
 
 
665 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  39.63 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  43.26 
 
 
663 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  43.26 
 
 
663 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  41.12 
 
 
567 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  39.42 
 
 
534 aa  399  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  38.3 
 
 
603 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  36.43 
 
 
589 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  39.34 
 
 
570 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  37.62 
 
 
575 aa  354  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  34.01 
 
 
611 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  36.68 
 
 
608 aa  347  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  36.22 
 
 
576 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  34.99 
 
 
669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  35.84 
 
 
576 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  37.88 
 
 
606 aa  326  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  34.54 
 
 
587 aa  323  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.54 
 
 
587 aa  323  7e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  35.53 
 
 
563 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  32.9 
 
 
588 aa  317  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  34.84 
 
 
586 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  34.26 
 
 
605 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  35.01 
 
 
606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  34.87 
 
 
626 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  36.04 
 
 
590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  36.15 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  31.87 
 
 
583 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  35.37 
 
 
615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  32.23 
 
 
630 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  34.57 
 
 
578 aa  297  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  34.22 
 
 
595 aa  295  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  33.45 
 
 
575 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  31.03 
 
 
579 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.64 
 
 
598 aa  293  8e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 
639 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  33.9 
 
 
614 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  33.65 
 
 
614 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  33.46 
 
 
614 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  31.63 
 
 
621 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  30.24 
 
 
712 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  33.45 
 
 
577 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  32.68 
 
 
589 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  32.68 
 
 
589 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.44 
 
 
589 aa  282  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  32.68 
 
 
589 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  32.8 
 
 
589 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
571 aa  280  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  33.09 
 
 
637 aa  280  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  32.62 
 
 
589 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  31.77 
 
 
713 aa  276  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  30.96 
 
 
596 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  33.39 
 
 
583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  32.43 
 
 
597 aa  275  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  31.05 
 
 
593 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  31.61 
 
 
614 aa  273  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.7 
 
 
592 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  30.93 
 
 
636 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  32.32 
 
 
589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  31.78 
 
 
613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  31.45 
 
 
636 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
588 aa  269  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  31.45 
 
 
634 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  31.45 
 
 
636 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.97 
 
 
588 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 
588 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 
588 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 
588 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.97 
 
 
588 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  31.48 
 
 
610 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.97 
 
 
584 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.97 
 
 
588 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  30.85 
 
 
701 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  30.63 
 
 
596 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  32.39 
 
 
704 aa  256  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  32.5 
 
 
708 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  31.84 
 
 
626 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  30.66 
 
 
635 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  32.18 
 
 
577 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  29.54 
 
 
595 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  32.36 
 
 
572 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  31.23 
 
 
563 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  29.03 
 
 
651 aa  250  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  33.08 
 
 
632 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  29.11 
 
 
591 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  27.78 
 
 
642 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  28.83 
 
 
674 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  31.61 
 
 
712 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  31.61 
 
 
704 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  29.23 
 
 
588 aa  242  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  28.8 
 
 
666 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>