More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4948 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  79.83 
 
 		 708 aa  1107    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  68.04 
 
 		 713 aa  926    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  100 
 
 		 704 aa  1417    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  99.72 
 
 		 712 aa  1413    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  92.76 
 
 		 704 aa  1307    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  48.88 
 
 		 596 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  42.56 
 
 		 712 aa  539  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  49.57 
 
 		 596 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  43.2 
 
 		 701 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  45.6 
 
 		 588 aa  505  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  46.29 
 
 		 579 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  46.18 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  44.76 
 
 		 586 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  46.18 
 
 		 583 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  44.89 
 
 		 593 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  42.54 
 
 		 588 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  41.5 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  42.67 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  42.83 
 
 		 606 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  41.39 
 
 		 610 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  41.86 
 
 		 614 aa  429  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  41.85 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  42.75 
 
 		 621 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.53 
 
 		 587 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  39.53 
 
 		 587 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  43.21 
 
 		 614 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  43.21 
 
 		 614 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  41.75 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  41.75 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  41.93 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  40.91 
 
 		 589 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  41.05 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  41.27 
 
 		 636 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  41.83 
 
 		 605 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  40.86 
 
 		 602 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  40.88 
 
 		 589 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  43.13 
 
 		 614 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  41.27 
 
 		 615 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  41.8 
 
 		 606 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  41.02 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  38.7 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  41.88 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  39.63 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 588 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  42.7 
 
 		 577 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  40.24 
 
 		 589 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  40.84 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.31 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  41.76 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.31 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.31 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.85 
 
 		 592 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.35 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  37.96 
 
 		 595 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  40.18 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.15 
 
 		 598 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  38.37 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  38.8 
 
 		 636 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  38.61 
 
 		 634 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  38.61 
 
 		 636 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.15 
 
 		 599 aa  360  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  37.85 
 
 		 597 aa  360  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 639 aa  349  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  36.38 
 
 		 637 aa  335  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  34.5 
 
 		 660 aa  333  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35.32 
 
 		 651 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  33.03 
 
 		 591 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  37.96 
 
 		 626 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  36.61 
 
 		 632 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  33.46 
 
 		 642 aa  320  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  34.02 
 
 		 666 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  34.86 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  33.65 
 
 		 674 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  35.06 
 
 		 553 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  36.36 
 
 		 557 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  35.21 
 
 		 670 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  35.21 
 
 		 670 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  36.16 
 
 		 557 aa  300  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  32.43 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  35.51 
 
 		 560 aa  297  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  34.07 
 
 		 600 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  31.87 
 
 		 621 aa  290  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  33.82 
 
 		 588 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  31.68 
 
 		 621 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  34.38 
 
 		 665 aa  288  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  37.58 
 
 		 603 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  32.83 
 
 		 534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  33.15 
 
 		 602 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  34.99 
 
 		 570 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  36.5 
 
 		 576 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  34.58 
 
 		 668 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  32.47 
 
 		 667 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  32.45 
 
 		 662 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  32.45 
 
 		 662 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  30.81 
 
 		 623 aa  273  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  34.91 
 
 		 576 aa  272  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  31.76 
 
 		 608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>