More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3684 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  77.97 
 
 
589 aa  956    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  99.32 
 
 
588 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  99.66 
 
 
588 aa  1197    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  75.34 
 
 
583 aa  900    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  99.66 
 
 
588 aa  1197    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  78.64 
 
 
589 aa  962    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  99.66 
 
 
588 aa  1197    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  96.94 
 
 
588 aa  1136    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 
588 aa  1200    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  75 
 
 
592 aa  901    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  59.27 
 
 
577 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  78.31 
 
 
589 aa  959    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  77.46 
 
 
589 aa  917    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  78.14 
 
 
589 aa  957    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  78.31 
 
 
589 aa  959    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  78.31 
 
 
589 aa  959    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  99.66 
 
 
584 aa  1188    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  99.66 
 
 
588 aa  1197    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  49.24 
 
 
621 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  48.79 
 
 
636 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  49.46 
 
 
614 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  49.46 
 
 
614 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  47.53 
 
 
578 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  46.6 
 
 
575 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  47.07 
 
 
588 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  48.75 
 
 
614 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  46.82 
 
 
579 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  47.13 
 
 
586 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  45.7 
 
 
606 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  46.68 
 
 
583 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  45.5 
 
 
613 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  45.67 
 
 
630 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  45.39 
 
 
610 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  45.08 
 
 
614 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  42.42 
 
 
590 aa  467  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  44.54 
 
 
588 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  41.85 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  45.49 
 
 
572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  43.75 
 
 
593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  41.53 
 
 
587 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.53 
 
 
587 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  43.5 
 
 
595 aa  438  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  40.48 
 
 
596 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  41.17 
 
 
708 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  39.57 
 
 
704 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  39.5 
 
 
603 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  39.03 
 
 
563 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  37.63 
 
 
600 aa  399  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  40.43 
 
 
596 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  39.35 
 
 
712 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  39.35 
 
 
704 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  37.94 
 
 
712 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  40.43 
 
 
713 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  37.63 
 
 
605 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  38.39 
 
 
701 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  39.77 
 
 
626 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  38.52 
 
 
615 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  38.9 
 
 
602 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  37 
 
 
553 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  36.71 
 
 
557 aa  359  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  37.71 
 
 
606 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  34.7 
 
 
651 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  33.79 
 
 
674 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  34.4 
 
 
660 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  35.96 
 
 
557 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  36.93 
 
 
597 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.94 
 
 
598 aa  347  5e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.23 
 
 
595 aa  345  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  32.53 
 
 
642 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  32.6 
 
 
666 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 
549 aa  332  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  37.16 
 
 
560 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  33.09 
 
 
591 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  33.81 
 
 
561 aa  330  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  33.63 
 
 
561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  33.45 
 
 
561 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  33.45 
 
 
561 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 
561 aa  326  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 
561 aa  323  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  35.56 
 
 
629 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  34.79 
 
 
609 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  34.12 
 
 
534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  34.69 
 
 
603 aa  313  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  33.51 
 
 
567 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  35.96 
 
 
667 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  36.27 
 
 
596 aa  309  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3439  ABC transporter related  34.19 
 
 
588 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  34.88 
 
 
576 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  34.48 
 
 
668 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  35.18 
 
 
576 aa  300  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  31.58 
 
 
635 aa  299  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  30.96 
 
 
634 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  30.96 
 
 
636 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  31.67 
 
 
608 aa  297  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  34.32 
 
 
665 aa  296  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  33.1 
 
 
589 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>