More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1064 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  64.2 
 
 		 610 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  64.4 
 
 		 613 aa  765    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  61.4 
 
 		 614 aa  750    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  100 
 
 		 593 aa  1208    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  45.81 
 
 		 588 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  45.77 
 
 		 575 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  45.38 
 
 		 621 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  44.79 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  44.79 
 
 		 614 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  44.82 
 
 		 579 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  42.46 
 
 		 636 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  44.75 
 
 		 586 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  44.98 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  44.35 
 
 		 630 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  44.56 
 
 		 614 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  44.09 
 
 		 578 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  45.52 
 
 		 589 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  44.46 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  45.34 
 
 		 589 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  45.34 
 
 		 589 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  45.34 
 
 		 589 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 577 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  45.85 
 
 		 572 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  45.52 
 
 		 589 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  43.19 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  45.34 
 
 		 589 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  44.82 
 
 		 606 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  44.58 
 
 		 595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  45.2 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  44.48 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  44.89 
 
 		 704 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  42.83 
 
 		 713 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  44.53 
 
 		 704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  44.71 
 
 		 712 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  44.13 
 
 		 592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  44.8 
 
 		 589 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  41.81 
 
 		 590 aa  442  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 		 588 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  41.07 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.75 
 
 		 584 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.75 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.75 
 
 		 588 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.75 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.14 
 
 		 587 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  42.14 
 
 		 587 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  42.86 
 
 		 596 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  41.3 
 
 		 701 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  41.31 
 
 		 602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  40.79 
 
 		 615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  40.74 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  40.03 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  38.51 
 
 		 712 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  39.58 
 
 		 606 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  38.09 
 
 		 563 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  39.36 
 
 		 597 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.5 
 
 		 598 aa  372  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.16 
 
 		 599 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  35.57 
 
 		 591 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  35.27 
 
 		 642 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  35.47 
 
 		 557 aa  336  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  35.17 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  35.17 
 
 		 634 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  35.17 
 
 		 636 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35.71 
 
 		 651 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.03 
 
 		 595 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  36 
 
 		 560 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  35.34 
 
 		 635 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 639 aa  327  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  36.23 
 
 		 553 aa  327  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  33.94 
 
 		 666 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  34.73 
 
 		 660 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  33.99 
 
 		 674 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  36.35 
 
 		 603 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  35.14 
 
 		 557 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  34.7 
 
 		 637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  34.88 
 
 		 600 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.63 
 
 		 561 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.52 
 
 		 561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  34.35 
 
 		 534 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  35.16 
 
 		 609 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  31.47 
 
 		 561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  31.47 
 
 		 561 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  30.16 
 
 		 561 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  36.84 
 
 		 576 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  35.58 
 
 		 576 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  35.43 
 
 		 633 aa  302  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  31.27 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.52 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  36.01 
 
 		 632 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  34.04 
 
 		 602 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  32 
 
 		 629 aa  296  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  34.62 
 
 		 626 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  33.33 
 
 		 665 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  32.31 
 
 		 663 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  35.31 
 
 		 575 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>