More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0707 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  100 
 
 
587 aa  1192    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 
587 aa  1192    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  51.43 
 
 
595 aa  559  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  46.82 
 
 
590 aa  548  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  47.15 
 
 
606 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  44.36 
 
 
588 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  45.16 
 
 
586 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  47.46 
 
 
575 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  45.34 
 
 
630 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  45.1 
 
 
579 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  45.41 
 
 
621 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  44.7 
 
 
583 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  44.2 
 
 
613 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  43.71 
 
 
614 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  43.71 
 
 
614 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  44.26 
 
 
578 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  43.94 
 
 
614 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  41.82 
 
 
713 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  42.26 
 
 
614 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  42.2 
 
 
610 aa  452  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  41.76 
 
 
589 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  41.56 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  43.01 
 
 
592 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  41.92 
 
 
636 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  41.56 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  42.88 
 
 
596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  41.56 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  42.03 
 
 
589 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  42.53 
 
 
583 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  42.03 
 
 
589 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  41.86 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  42.37 
 
 
596 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  44.08 
 
 
588 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  42.14 
 
 
593 aa  432  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 
588 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  41.4 
 
 
589 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  40.72 
 
 
595 aa  428  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
577 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
588 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  42.6 
 
 
708 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
588 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
588 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.53 
 
 
584 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.53 
 
 
588 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.53 
 
 
588 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.53 
 
 
588 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  39.71 
 
 
712 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  41.33 
 
 
712 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  44.67 
 
 
572 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  41.49 
 
 
605 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  39.53 
 
 
704 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  42.45 
 
 
602 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  39.53 
 
 
704 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.18 
 
 
598 aa  415  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  39.72 
 
 
606 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  41.75 
 
 
626 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  41.54 
 
 
615 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  40.77 
 
 
701 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  38.76 
 
 
597 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  36.78 
 
 
636 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  36.61 
 
 
634 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  36.61 
 
 
636 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.1 
 
 
599 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  36.7 
 
 
635 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  37.43 
 
 
563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  36.08 
 
 
567 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  37.59 
 
 
557 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  36.74 
 
 
637 aa  353  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 
639 aa  349  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  34.34 
 
 
674 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  34.28 
 
 
666 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  36.38 
 
 
651 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  35.28 
 
 
534 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  33.1 
 
 
660 aa  336  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  35.91 
 
 
557 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  36.3 
 
 
553 aa  333  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  36.08 
 
 
626 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  38.41 
 
 
603 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  35.06 
 
 
623 aa  329  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  33.57 
 
 
642 aa  327  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  36.84 
 
 
632 aa  326  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  34.37 
 
 
660 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  35.51 
 
 
663 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  35.51 
 
 
663 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  34.54 
 
 
660 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  33.64 
 
 
591 aa  323  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  35.78 
 
 
633 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  36.21 
 
 
570 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  33.62 
 
 
660 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  33.1 
 
 
621 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  33.27 
 
 
621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  35.48 
 
 
600 aa  320  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  34.95 
 
 
662 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 
662 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  35.35 
 
 
668 aa  312  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  33.99 
 
 
662 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  33.33 
 
 
667 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  33.55 
 
 
670 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  33.55 
 
 
670 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  36.82 
 
 
640 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>