176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1935 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1935  SbmABacA family protein  100 
 
 		 370 aa  755    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3628  ABC transporter-like  81.92 
 
 		 368 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.519453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1839  ABC transporter-like  79.89 
 
 		 370 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4701  ABC transporter-like  66.67 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6480  putative ABC transporter-like protein  44.05 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  39.83 
 
 		 642 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  41.38 
 
 		 674 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  40.74 
 
 		 651 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  40.41 
 
 		 666 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  38.95 
 
 		 660 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  40 
 
 		 591 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  31.36 
 
 		 621 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  31.3 
 
 		 614 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  31.3 
 
 		 614 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  30.95 
 
 		 636 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  31.55 
 
 		 614 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  30.22 
 
 		 614 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  29.18 
 
 		 610 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  27.08 
 
 		 606 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  29.33 
 
 		 621 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  29.05 
 
 		 616 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  26.85 
 
 		 613 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  27.19 
 
 		 588 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  28.28 
 
 		 578 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  27.14 
 
 		 593 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  30.56 
 
 		 583 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  28.9 
 
 		 621 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  28.61 
 
 		 621 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  30.72 
 
 		 602 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  29.87 
 
 		 630 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  27.61 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.19 
 
 		 590 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.73 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.73 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.73 
 
 		 588 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.73 
 
 		 584 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  29.04 
 
 		 609 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  25.34 
 
 		 575 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  27.45 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  27.53 
 
 		 713 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.02 
 
 		 599 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  28.09 
 
 		 579 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  27.73 
 
 		 629 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  29.56 
 
 		 588 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  25.14 
 
 		 590 aa  129  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  26.22 
 
 		 577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  28.7 
 
 		 623 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.44 
 
 		 589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  28.89 
 
 		 606 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  28.84 
 
 		 596 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5526  ABC transporter domain protein  26.93 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  25.07 
 
 		 589 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  25.07 
 
 		 589 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  25.07 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  25.52 
 
 		 589 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  25.52 
 
 		 589 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  24.93 
 
 		 587 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.93 
 
 		 587 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  27.05 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  25.71 
 
 		 561 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  25.39 
 
 		 561 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  25.39 
 
 		 561 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  25.58 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  28.01 
 
 		 596 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  25.39 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  25.39 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  25.71 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  25.39 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  29.94 
 
 		 595 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  24.86 
 
 		 553 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  26.49 
 
 		 712 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  26.49 
 
 		 704 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  26.18 
 
 		 572 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  25 
 
 		 592 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  25.08 
 
 		 561 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  26.15 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  25.08 
 
 		 561 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  24.84 
 
 		 596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.27 
 
 		 549 aa  113  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  24.93 
 
 		 583 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  24.79 
 
 		 557 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  26.29 
 
 		 577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  25.89 
 
 		 704 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  25 
 
 		 701 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  26.06 
 
 		 560 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  25.87 
 
 		 588 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  25.08 
 
 		 603 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  26.18 
 
 		 708 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.78 
 
 		 598 aa  104  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  23.81 
 
 		 712 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  25 
 
 		 663 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  25 
 
 		 663 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  24.14 
 
 		 597 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  26.82 
 
 		 626 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  25.08 
 
 		 606 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  20.78 
 
 		 595 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  26.82 
 
 		 602 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>