More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0331 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  88.93 
 
 
614 aa  1089    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  63.55 
 
 
621 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  61.64 
 
 
636 aa  770    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  100 
 
 
614 aa  1253    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  99.67 
 
 
614 aa  1251    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  52.58 
 
 
578 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  48.74 
 
 
577 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  49.46 
 
 
589 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
588 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.73 
 
 
588 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
588 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  49.28 
 
 
589 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.73 
 
 
584 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 
588 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  49.28 
 
 
589 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.73 
 
 
588 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  49.46 
 
 
589 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  47.91 
 
 
583 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.55 
 
 
588 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  49.82 
 
 
589 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  49.09 
 
 
589 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  49.28 
 
 
589 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  49.37 
 
 
575 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
588 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  49.46 
 
 
592 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  45.61 
 
 
613 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  46.86 
 
 
588 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  45.64 
 
 
610 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  47.45 
 
 
579 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  45.67 
 
 
614 aa  515  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  44.79 
 
 
593 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  46.59 
 
 
586 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  45.63 
 
 
583 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  46.28 
 
 
606 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  46.06 
 
 
630 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  48.38 
 
 
577 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  43.71 
 
 
587 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.71 
 
 
587 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  47.23 
 
 
572 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  41.61 
 
 
590 aa  477  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  44.44 
 
 
588 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  42.69 
 
 
595 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  41.34 
 
 
599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  42.42 
 
 
596 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  41.95 
 
 
596 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  44.14 
 
 
708 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  42.99 
 
 
704 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  41.89 
 
 
713 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  42.8 
 
 
712 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  41.83 
 
 
704 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  39.64 
 
 
563 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.25 
 
 
598 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  38.81 
 
 
557 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  38.35 
 
 
701 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  39.52 
 
 
602 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  39.72 
 
 
605 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  39.36 
 
 
615 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  38.95 
 
 
557 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  39.01 
 
 
626 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  37.23 
 
 
660 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  37.17 
 
 
712 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  38.45 
 
 
595 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  40.07 
 
 
606 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  37.34 
 
 
553 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  36.75 
 
 
651 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  37.46 
 
 
603 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  36.86 
 
 
674 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  35.52 
 
 
642 aa  359  9e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  36.43 
 
 
591 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  38.08 
 
 
597 aa  355  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  35.64 
 
 
666 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  35.65 
 
 
600 aa  350  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  34.52 
 
 
636 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  34.35 
 
 
634 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  34.35 
 
 
636 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  35.09 
 
 
609 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  36.6 
 
 
588 aa  323  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 
639 aa  323  6e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.36 
 
 
549 aa  320  6e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  34.92 
 
 
626 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  32.65 
 
 
635 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  35.78 
 
 
637 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  34.08 
 
 
633 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  34.73 
 
 
602 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  36.23 
 
 
560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  37.28 
 
 
570 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  32.12 
 
 
621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  34.14 
 
 
665 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  32.26 
 
 
616 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  35.24 
 
 
534 aa  311  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  33.04 
 
 
589 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.89 
 
 
590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  35.71 
 
 
667 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  32.69 
 
 
629 aa  300  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  32.41 
 
 
670 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  32.41 
 
 
670 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  34.12 
 
 
632 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  33.62 
 
 
608 aa  297  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  34.09 
 
 
567 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  35.78 
 
 
596 aa  296  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>