More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3410 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 639 aa  771    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  100 
 
 		 635 aa  1273    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  82.12 
 
 		 634 aa  1082    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  82.05 
 
 		 636 aa  1087    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  82.05 
 
 		 636 aa  1087    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  81.75 
 
 		 637 aa  1041    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  53.5 
 
 		 633 aa  625  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  53.43 
 
 		 626 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  53.27 
 
 		 632 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  49.78 
 
 		 670 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  49.78 
 
 		 670 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  43.84 
 
 		 626 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  44 
 
 		 615 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  43.25 
 
 		 605 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  43.79 
 
 		 597 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  44.23 
 
 		 602 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  43.23 
 
 		 606 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.33 
 
 		 598 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  38.37 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  38.71 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  38.37 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  37.21 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  36.7 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  38.98 
 
 		 708 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.7 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  32.85 
 
 		 712 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  39.96 
 
 		 713 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35.05 
 
 		 588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  35.51 
 
 		 586 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  35.94 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  35.1 
 
 		 630 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  36.52 
 
 		 613 aa  353  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  35.82 
 
 		 596 aa  346  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  35.57 
 
 		 579 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  35 
 
 		 575 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  33.61 
 
 		 701 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  34.45 
 
 		 610 aa  337  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  32.17 
 
 		 590 aa  337  5.999999999999999e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  35.46 
 
 		 595 aa  331  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  36.98 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  33.33 
 
 		 578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  35.34 
 
 		 593 aa  329  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  36.21 
 
 		 606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  33.5 
 
 		 614 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.07 
 
 		 595 aa  319  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  33.91 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  32.99 
 
 		 588 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  33.65 
 
 		 614 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  35.66 
 
 		 636 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  35.46 
 
 		 563 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  33.65 
 
 		 614 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.68 
 
 		 589 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  32.65 
 
 		 589 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.05 
 
 		 599 aa  301  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  31.34 
 
 		 589 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  31.34 
 
 		 589 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  31.34 
 
 		 589 aa  297  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.08 
 
 		 592 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  31.86 
 
 		 583 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  32.28 
 
 		 614 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  33.66 
 
 		 589 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  33.66 
 
 		 589 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.76 
 
 		 588 aa  293  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  34.15 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 588 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 588 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.76 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 588 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.76 
 
 		 584 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.76 
 
 		 588 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  32.65 
 
 		 534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  35.19 
 
 		 576 aa  281  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  33.78 
 
 		 603 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  31.82 
 
 		 663 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  31.82 
 
 		 663 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  30.2 
 
 		 651 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  34.64 
 
 		 560 aa  273  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  32.08 
 
 		 667 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  32.29 
 
 		 667 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  31.66 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  34.77 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  30.2 
 
 		 660 aa  264  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  30.56 
 
 		 660 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  32.24 
 
 		 668 aa  263  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  29.57 
 
 		 589 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  31.22 
 
 		 567 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  32.05 
 
 		 665 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  32.43 
 
 		 674 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  34.79 
 
 		 603 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  34.73 
 
 		 575 aa  260  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  31.28 
 
 		 557 aa  259  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 561 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.97 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  30.97 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  30.97 
 
 		 561 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  30.97 
 
 		 561 aa  257  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 561 aa  257  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  30.97 
 
 		 561 aa  257  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>