More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3409 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  54.73 
 
 
639 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  53.5 
 
 
635 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  60.81 
 
 
670 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  52.61 
 
 
634 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  100 
 
 
633 aa  1268    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  65.43 
 
 
626 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  52.45 
 
 
636 aa  661    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  60.81 
 
 
670 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  52.45 
 
 
636 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  85.76 
 
 
632 aa  1039    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  53.18 
 
 
637 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  45.35 
 
 
605 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  44.11 
 
 
626 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  44.27 
 
 
615 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  45.02 
 
 
602 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  45 
 
 
606 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  42.58 
 
 
597 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.97 
 
 
598 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  35.01 
 
 
610 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  35.6 
 
 
704 aa  344  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  34.61 
 
 
579 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.78 
 
 
587 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  35.78 
 
 
587 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  34.03 
 
 
588 aa  339  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  34.08 
 
 
586 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  35.19 
 
 
596 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  34.86 
 
 
712 aa  336  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  34.86 
 
 
704 aa  336  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.04 
 
 
595 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  35.05 
 
 
614 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  35.05 
 
 
614 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  33.28 
 
 
614 aa  329  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  33.8 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  33.45 
 
 
575 aa  327  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  31.91 
 
 
590 aa  326  6e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  33.55 
 
 
613 aa  326  9e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  35.51 
 
 
708 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  34.31 
 
 
606 aa  323  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  35.58 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  35.9 
 
 
595 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  35.08 
 
 
588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  33.23 
 
 
713 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  33.22 
 
 
630 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  35.13 
 
 
593 aa  320  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  32.82 
 
 
712 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  32.98 
 
 
578 aa  317  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  34.56 
 
 
621 aa  313  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  32.47 
 
 
614 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  32.48 
 
 
583 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  32.32 
 
 
636 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  33.04 
 
 
701 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  33.98 
 
 
563 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 
577 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.14 
 
 
592 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
584 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
588 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
588 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 
588 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 
588 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
588 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 
588 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  32.8 
 
 
572 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  31.79 
 
 
588 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.07 
 
 
589 aa  286  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  30.9 
 
 
589 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  30.73 
 
 
589 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  30.73 
 
 
589 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  30.9 
 
 
589 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.53 
 
 
599 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  31.46 
 
 
589 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  29.85 
 
 
577 aa  280  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  30.73 
 
 
589 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  31.76 
 
 
667 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  29.73 
 
 
589 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  30.5 
 
 
660 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  33.85 
 
 
667 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  30.1 
 
 
660 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  29.93 
 
 
660 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  31.94 
 
 
665 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  30.1 
 
 
662 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  29.64 
 
 
557 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  30.82 
 
 
534 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  33.22 
 
 
658 aa  253  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  30.62 
 
 
567 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 
660 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  33.33 
 
 
603 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  29.91 
 
 
662 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  31.72 
 
 
668 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  29.74 
 
 
662 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  30.28 
 
 
663 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  30.28 
 
 
663 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  30.59 
 
 
570 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3439  ABC transporter related  31.21 
 
 
588 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  28.75 
 
 
557 aa  240  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  30.53 
 
 
660 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  31.16 
 
 
603 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  31.21 
 
 
553 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  32.68 
 
 
575 aa  233  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  28.57 
 
 
651 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  31.91 
 
 
576 aa  230  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.550427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>