289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1539 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
335 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  99.4 
 
 
335 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  85.67 
 
 
335 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2495  glycosyl transferase family 2  37.58 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5932  succinoglycan biosynthesis protein  34.34 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4950  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
319 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198501  normal  0.142154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0115  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
339 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.25 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
597 aa  65.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.98 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.89 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.98 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.05 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.04 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  42.73 
 
 
235 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
317 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3845  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
261 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  33.67 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  34.82 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  32.23 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  33.33 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  34.55 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  33.05 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.85 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.14 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
402 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
271 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  28.1 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  32.29 
 
 
309 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
482 aa  52.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
324 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 
300 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
340 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 
672 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1691  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.62 
 
 
256 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
316 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  27.52 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  33.04 
 
 
391 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  50.88 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
296 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  33.33 
 
 
102 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
573 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  33.81 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  28.32 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
573 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
305 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>