More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1379 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 297 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.47 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.93 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 357 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.65 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.37 
 
 		 326 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.37 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.23 
 
 		 326 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.38 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 544 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 390 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 		 584 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.05 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  31.28 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  43.33 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 672 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 1035 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  31.12 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  28.31 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.12 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.12 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 689 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  31.12 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  35.05 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.06 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.33 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.61 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  31.61 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>