More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2946 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
335 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  85.67 
 
 
335 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  85.67 
 
 
335 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2495  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5932  succinoglycan biosynthesis protein  30.16 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4950  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 
319 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198501  normal  0.142154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0115  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
339 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  22.59 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.88 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.88 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
261 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.41 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
275 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.86 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
379 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
300 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  35.34 
 
 
346 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3845  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
385 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.42 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  33.67 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  35.96 
 
 
391 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  38.18 
 
 
672 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  33.9 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  23.29 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
402 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  30.64 
 
 
309 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
300 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  36.44 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.17 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  33.08 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.43 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.8 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  36.46 
 
 
1168 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
235 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
252 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  39.66 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
230 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  35.51 
 
 
338 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  35.65 
 
 
316 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  34.23 
 
 
314 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
380 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
347 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  27.33 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
261 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
958 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
332 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  29.36 
 
 
314 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
328 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
310 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
331 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.95 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  32.35 
 
 
102 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.2 
 
 
1157 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>