More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4950 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4950  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 319 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198501  normal  0.142154 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5932  succinoglycan biosynthesis protein  67.71 
 
 		 319 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0115  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2495  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  40.19 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  37.93 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  44.66 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.72 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  41.58 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.72 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.76 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  42.61 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  41.44 
 
 		 785 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  44 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  37.27 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.92 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.92 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.39 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.08 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  38.54 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  39.09 
 
 		 1157 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1670  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 219 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  40.74 
 
 		 1169 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.68 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  32.87 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  29.05 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 704 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  43 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 		 721 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.87 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  35.14 
 
 		 672 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  32.74 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.57 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  40.43 
 
 		 1168 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  34 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  30 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  35.51 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  39 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  31.67 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.15 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  31.43 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  36.63 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>